73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4403 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4403  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 450 aa  887    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0183  von Willebrand factor type A  61.86 
 
 		 432 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2163  von Willebrand factor type A  49.66 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.820546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3066  von Willebrand factor type A  49.53 
 
 		 425 aa  350  3e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000574906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0368  von Willebrand factor type A  47.21 
 
 		 428 aa  329  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00177271  decreased coverage  0.000715031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4557  von Willebrand factor type A  44.52 
 
 		 425 aa  329  6e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal  0.659076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4946  von Willebrand factor type A  46.67 
 
 		 431 aa  325  9e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0264631  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2461  von Willebrand factor type A  43.11 
 
 		 432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0207463  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0400  von Willebrand factor type A  37.59 
 
 		 476 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2532  von Willebrand factor type A  40.71 
 
 		 464 aa  203  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.177592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1137  serine/threonine protein kinase  36.27 
 
 		 962 aa  183  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4249  hypothetical protein  48.63 
 
 		 145 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.832481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  29.92 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  26.76 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  29.44 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  26.85 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  26.86 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  25.07 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  27.81 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  28.51 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  35.25 
 
 		 755 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  28.96 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  34.43 
 
 		 759 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  37.96 
 
 		 903 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  25.68 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  35.25 
 
 		 751 aa  57.4  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  27.39 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  27.39 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  25.3 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  25.21 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  31.19 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 		 412 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.97 
 
 		 723 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  29.22 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.25 
 
 		 712 aa  54.7  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  29.95 
 
 		 430 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  27.98 
 
 		 412 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.25 
 
 		 755 aa  53.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4136  von Willebrand factor type A  32.79 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  26.88 
 
 		 427 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  23.7 
 
 		 446 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  35.14 
 
 		 732 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  33.88 
 
 		 753 aa  51.6  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.2 
 
 		 722 aa  51.6  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  28.99 
 
 		 416 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  35.29 
 
 		 738 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  32.79 
 
 		 760 aa  50.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  26.42 
 
 		 425 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30 
 
 		 786 aa  50.1  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  24.73 
 
 		 467 aa  49.7  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566184 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0004  von Willebrand factor, type A  21.07 
 
 		 464 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  29.75 
 
 		 757 aa  49.7  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  29.82 
 
 		 523 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  23.85 
 
 		 763 aa  47.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.86 
 
 		 812 aa  47.4  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  26.67 
 
 		 739 aa  47  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  31.48 
 
 		 755 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  34.09 
 
 		 789 aa  46.6  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1830  von Willebrand factor type A  26.71 
 
 		 573 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  33.94 
 
 		 794 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  31.69 
 
 		 711 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32.46 
 
 		 588 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  33.03 
 
 		 791 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.37 
 
 		 691 aa  45.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.01 
 
 		 776 aa  45.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  30.3 
 
 		 918 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  30.41 
 
 		 412 aa  45.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  30.56 
 
 		 363 aa  44.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  32.73 
 
 		 419 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  31.5 
 
 		 750 aa  45.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  35.71 
 
 		 795 aa  44.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  33.07 
 
 		 561 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  33.07 
 
 		 958 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>