70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2532 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2532  von Willebrand factor type A  100 
 
 
464 aa  904    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.177592  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0183  von Willebrand factor type A  42.76 
 
 
432 aa  259  6e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2163  von Willebrand factor type A  39.72 
 
 
440 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.820546  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4946  von Willebrand factor type A  44.72 
 
 
431 aa  247  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0264631  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0400  von Willebrand factor type A  39.32 
 
 
476 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0368  von Willebrand factor type A  40.71 
 
 
428 aa  239  9e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00177271  decreased coverage  0.000715031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4557  von Willebrand factor type A  36.88 
 
 
425 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal  0.659076 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3066  von Willebrand factor type A  40.29 
 
 
425 aa  219  8.999999999999998e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000574906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4403  von Willebrand factor type A  40.71 
 
 
450 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2461  von Willebrand factor type A  40.56 
 
 
432 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0207463  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1137  serine/threonine protein kinase  34.97 
 
 
962 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  27.52 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  28.47 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  27.95 
 
 
418 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  27.15 
 
 
419 aa  70.5  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  28.82 
 
 
418 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  24.59 
 
 
418 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  25.7 
 
 
418 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.21 
 
 
722 aa  62.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  26.84 
 
 
467 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566184 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  27.52 
 
 
427 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.92 
 
 
738 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  31.29 
 
 
1077 aa  60.1  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  28.82 
 
 
418 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.55 
 
 
723 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  30.29 
 
 
415 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.63 
 
 
725 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  26.39 
 
 
426 aa  56.6  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.48 
 
 
712 aa  56.6  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.98 
 
 
772 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  25.65 
 
 
757 aa  56.6  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.99 
 
 
732 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  28.99 
 
 
592 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.19 
 
 
759 aa  54.7  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.64 
 
 
772 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  30.65 
 
 
412 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  26.17 
 
 
771 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  32.28 
 
 
761 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  26.83 
 
 
423 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.36 
 
 
751 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.98 
 
 
729 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.32 
 
 
755 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  27.04 
 
 
760 aa  51.6  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 
418 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  33.71 
 
 
914 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0004  von Willebrand factor, type A  22.59 
 
 
464 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  26.73 
 
 
625 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.44 
 
 
740 aa  50.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  31.6 
 
 
412 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  29.35 
 
 
750 aa  50.1  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  29.68 
 
 
420 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.59 
 
 
442 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  29.59 
 
 
791 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.58 
 
 
771 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  25.99 
 
 
421 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  28.4 
 
 
903 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  27.24 
 
 
441 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  28.69 
 
 
479 aa  47.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  40.16 
 
 
774 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  29.02 
 
 
753 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  25.65 
 
 
739 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  31.86 
 
 
563 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  31.65 
 
 
755 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30 
 
 
755 aa  43.9  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  28.74 
 
 
842 aa  43.9  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  24.83 
 
 
966 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49215  predicted protein  25.76 
 
 
582 aa  43.5  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.108223  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  24.67 
 
 
459 aa  43.9  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  25.37 
 
 
363 aa  43.1  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4249  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  43.1  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.832481  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>