45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2163 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2163  von Willebrand factor type A  100 
 
 
440 aa  890    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.820546  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0183  von Willebrand factor type A  50.34 
 
 
432 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4403  von Willebrand factor type A  48.98 
 
 
450 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4946  von Willebrand factor type A  48.74 
 
 
431 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0264631  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0368  von Willebrand factor type A  46.21 
 
 
428 aa  357  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00177271  decreased coverage  0.000715031 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3066  von Willebrand factor type A  46.8 
 
 
425 aa  347  2e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000574906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4557  von Willebrand factor type A  44.01 
 
 
425 aa  331  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal  0.659076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1137  serine/threonine protein kinase  46.3 
 
 
962 aa  290  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2461  von Willebrand factor type A  42.57 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0207463  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2532  von Willebrand factor type A  39.95 
 
 
464 aa  234  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.177592  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0400  von Willebrand factor type A  35.8 
 
 
476 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4249  hypothetical protein  46.98 
 
 
145 aa  103  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.832481  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  26.99 
 
 
419 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  26.91 
 
 
420 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  25.98 
 
 
419 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  28.37 
 
 
412 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  29.7 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  28.97 
 
 
418 aa  63.5  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  27.1 
 
 
418 aa  63.2  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  31.76 
 
 
418 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  30.09 
 
 
427 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  23.66 
 
 
423 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  30.04 
 
 
412 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  29.07 
 
 
418 aa  57  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  25.46 
 
 
425 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  27.95 
 
 
421 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  29.49 
 
 
393 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  26.91 
 
 
418 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  26.91 
 
 
418 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.69 
 
 
755 aa  53.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  28.88 
 
 
903 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  28.68 
 
 
888 aa  52.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  24.23 
 
 
421 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  28.84 
 
 
415 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  26.03 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  26.11 
 
 
426 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  29.27 
 
 
819 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.21 
 
 
738 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  37.5 
 
 
316 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  29.17 
 
 
914 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  26.07 
 
 
480 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  24.61 
 
 
446 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0004  von Willebrand factor, type A  24.38 
 
 
464 aa  43.5  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  25.97 
 
 
717 aa  43.1  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  26.49 
 
 
363 aa  43.1  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>