47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0295 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0295  vault protein inter-alpha-trypsin  100 
 
 		 995 aa  2042    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00370516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3062  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  34.72 
 
 		 984 aa  599  1e-170  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2477  hypothetical protein  34.43 
 
 		 992 aa  570  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184778  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1819  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  34.08 
 
 		 963 aa  524  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.541917  normal  0.345133 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4001  hypothetical protein  31.26 
 
 		 959 aa  521  1e-146  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000175491  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16980  uncharacterized conserved protein (DUF2135)  26.73 
 
 		 1115 aa  318  3e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2860  hypothetical protein  22.55 
 
 		 1066 aa  196  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.27882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3164  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1120 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3359  hypothetical protein  40.68 
 
 		 258 aa  95.5  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.783819  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1433  conserved hypothetical protein  40.68 
 
 		 258 aa  95.5  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02111  hypothetical protein  40.68 
 
 		 258 aa  95.5  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.529062  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1425  hypothetical protein  40.68 
 
 		 258 aa  95.5  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2521  hypothetical protein  40.68 
 
 		 258 aa  95.5  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000025623  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2366  hypothetical protein  40.68 
 
 		 258 aa  95.5  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02152  hypothetical protein  40.68 
 
 		 258 aa  95.5  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.5101  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3027  signal peptide protein  34.48 
 
 		 282 aa  87.8  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0193368  normal  0.0163712 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2960  signal peptide protein  33.1 
 
 		 280 aa  80.5  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0142734 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3307  putative signal peptide protein  33.1 
 
 		 280 aa  80.9  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0281892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5101  hypothetical protein  35.66 
 
 		 263 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58230  hypothetical protein  35.66 
 
 		 263 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2374  hypothetical protein  39.83 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2571  hypothetical protein  35.11 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  3.51589e-17  normal  0.0950053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4998  hypothetical protein  32.56 
 
 		 270 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6588  hypothetical protein  35.11 
 
 		 271 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683037  normal  0.0152413 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  27.69 
 
 		 713 aa  55.8  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  22.26 
 
 		 786 aa  54.3  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  30.91 
 
 		 753 aa  53.5  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5003  hypothetical protein  25.76 
 
 		 263 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.48 
 
 		 791 aa  51.2  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58290  hypothetical protein  29.59 
 
 		 269 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5106  hypothetical protein  29.59 
 
 		 269 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.72 
 
 		 794 aa  50.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  29.06 
 
 		 775 aa  50.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  29.2 
 
 		 761 aa  47.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 		 1737 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2506  hypothetical protein  24.66 
 
 		 461 aa  46.6  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.280474  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3028  putative signal peptide protein  23.88 
 
 		 267 aa  46.6  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0370173  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.95 
 
 		 755 aa  47  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2961  putative signal peptide protein  22.56 
 
 		 267 aa  46.6  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147846 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  24.28 
 
 		 789 aa  46.6  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4959  hypothetical protein  33.33 
 
 		 826 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0521836  normal  0.194577 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 927 aa  46.2  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3308  putative signal peptide protein  22.56 
 
 		 267 aa  46.2  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.027267 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.39 
 
 		 222 aa  45.8  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 878 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  25 
 
 		 763 aa  45.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.89 
 
 		 810 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>