47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_4001 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_4001  hypothetical protein  100 
 
 		 959 aa  1923    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000175491  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3062  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  42.69 
 
 		 984 aa  739    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0295  vault protein inter-alpha-trypsin  31.63 
 
 		 995 aa  518  1.0000000000000001e-145  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00370516  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2477  hypothetical protein  28.25 
 
 		 992 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184778  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16980  uncharacterized conserved protein (DUF2135)  25.92 
 
 		 1115 aa  298  4e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1819  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  24.64 
 
 		 963 aa  241  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.541917  normal  0.345133 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2860  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1066 aa  176  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.27882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3164  hypothetical protein  20.75 
 
 		 1120 aa  89.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  19.72 
 
 		 775 aa  73.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02152  hypothetical protein  32.76 
 
 		 258 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.5101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02111  hypothetical protein  32.76 
 
 		 258 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.529062  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3359  hypothetical protein  32.76 
 
 		 258 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.783819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1425  hypothetical protein  32.76 
 
 		 258 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2521  hypothetical protein  32.76 
 
 		 258 aa  67.8  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000025623  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2366  hypothetical protein  32.76 
 
 		 258 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1433  conserved hypothetical protein  32.76 
 
 		 258 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5101  hypothetical protein  29.01 
 
 		 263 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58230  hypothetical protein  29.01 
 
 		 263 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  20.42 
 
 		 701 aa  62.4  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  23.62 
 
 		 1109 aa  59.7  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4998  hypothetical protein  27.69 
 
 		 270 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2571  hypothetical protein  29.91 
 
 		 270 aa  56.2  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  3.51589e-17  normal  0.0950053 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  20.52 
 
 		 691 aa  56.2  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6588  hypothetical protein  29.91 
 
 		 271 aa  55.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683037  normal  0.0152413 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2374  hypothetical protein  31.9 
 
 		 258 aa  55.1  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  24.06 
 
 		 796 aa  52.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  22.38 
 
 		 755 aa  53.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  26.56 
 
 		 713 aa  50.8  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  23.31 
 
 		 774 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3027  signal peptide protein  28.81 
 
 		 282 aa  49.7  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0193368  normal  0.0163712 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.2 
 
 		 786 aa  50.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3974  hypothetical protein  23.16 
 
 		 922 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000192393  hitchhiker  0.00265498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  26.72 
 
 		 819 aa  49.3  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.24 
 
 		 680 aa  48.5  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  19.83 
 
 		 740 aa  48.5  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  24.65 
 
 		 789 aa  48.5  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  18.99 
 
 		 776 aa  48.1  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  25.66 
 
 		 753 aa  48.1  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4959  hypothetical protein  27.66 
 
 		 826 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0521836  normal  0.194577 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  24.83 
 
 		 763 aa  47  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3307  putative signal peptide protein  30.61 
 
 		 280 aa  47  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0281892 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2960  signal peptide protein  32.67 
 
 		 280 aa  46.2  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0142734 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  25.64 
 
 		 739 aa  46.6  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3233  hypothetical protein  37.5 
 
 		 884 aa  46.2  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  22.42 
 
 		 791 aa  45.8  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  21.82 
 
 		 794 aa  45.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  20.5 
 
 		 722 aa  45.1  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>