140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4538 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
2588 aa  5139    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  41.34 
 
 
2487 aa  434  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  48.92 
 
 
3191 aa  288  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  35.96 
 
 
4071 aa  189  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  34.09 
 
 
1634 aa  184  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  35.04 
 
 
2833 aa  179  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  30.41 
 
 
2478 aa  172  8e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  35.13 
 
 
2602 aa  165  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  31.19 
 
 
3089 aa  146  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  28.29 
 
 
2344 aa  144  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  28.93 
 
 
2402 aa  141  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  32.35 
 
 
2267 aa  134  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  45.83 
 
 
1665 aa  110  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0770  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  47.83 
 
 
231 aa  103  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3021  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  44.54 
 
 
337 aa  98.6  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0359  peptidase M12B ADAM/reprolysin  32.76 
 
 
1008 aa  95.5  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.199443  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  39.2 
 
 
693 aa  85.5  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0455  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  44.74 
 
 
171 aa  84.7  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  41.74 
 
 
3602 aa  84.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  41.96 
 
 
2064 aa  82.8  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  37.74 
 
 
3737 aa  77.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24760  conserved repeat protein  32.37 
 
 
1516 aa  73.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.216781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  28.88 
 
 
3793 aa  72.8  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  36.08 
 
 
3324 aa  72.4  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 
4896 aa  72.4  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  39.58 
 
 
1371 aa  72  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  35.85 
 
 
2005 aa  72  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1697  hypothetical protein  36.61 
 
 
1461 aa  70.5  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  41.82 
 
 
1139 aa  69.3  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  38.71 
 
 
815 aa  69.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  29.38 
 
 
4978 aa  68.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2383  putative surface protein  30.81 
 
 
929 aa  68.2  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2040  hypothetical protein  34.58 
 
 
2022 aa  68.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0726199  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  35.25 
 
 
1259 aa  67.8  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  30.29 
 
 
871 aa  66.6  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  41.57 
 
 
822 aa  67  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  31.25 
 
 
1059 aa  66.6  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  29.22 
 
 
3227 aa  66.2  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  30.5 
 
 
3471 aa  66.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  42.68 
 
 
5745 aa  65.9  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  36.25 
 
 
1547 aa  65.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  34.17 
 
 
540 aa  65.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  33.33 
 
 
2367 aa  64.7  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  33.33 
 
 
2421 aa  65.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  33.33 
 
 
2454 aa  64.3  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  33.33 
 
 
2411 aa  64.3  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  31.91 
 
 
2377 aa  64.3  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  40.91 
 
 
799 aa  63.9  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  33.33 
 
 
2807 aa  63.5  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  30.47 
 
 
1526 aa  63.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  32.68 
 
 
750 aa  63.2  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  40 
 
 
1162 aa  62.8  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  36.36 
 
 
3927 aa  62  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  43.06 
 
 
637 aa  60.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  38.04 
 
 
794 aa  60.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  34.94 
 
 
1483 aa  60.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  35.85 
 
 
852 aa  60.8  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  36.56 
 
 
2772 aa  60.1  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  38.95 
 
 
315 aa  59.7  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  34.69 
 
 
711 aa  59.7  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  42.5 
 
 
1606 aa  59.3  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  36.19 
 
 
1111 aa  59.3  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  35.88 
 
 
676 aa  58.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0357  hypothetical protein  27.04 
 
 
998 aa  58.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525924  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  35.87 
 
 
627 aa  59.3  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  30.61 
 
 
2239 aa  58.2  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  26.92 
 
 
2927 aa  58.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  33.72 
 
 
599 aa  58.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  33.7 
 
 
1389 aa  58.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  32.17 
 
 
1620 aa  58.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  32.59 
 
 
1602 aa  58.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 
4013 aa  58.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  29.08 
 
 
535 aa  57.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  36.56 
 
 
1230 aa  57  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  33.85 
 
 
532 aa  57  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  32.63 
 
 
636 aa  57  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  33.33 
 
 
496 aa  56.2  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  39.36 
 
 
969 aa  55.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  26.67 
 
 
2270 aa  55.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  26.2 
 
 
334 aa  55.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  25.31 
 
 
886 aa  55.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  39.36 
 
 
963 aa  55.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  30.83 
 
 
1245 aa  55.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  30.82 
 
 
561 aa  54.7  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  39.58 
 
 
1222 aa  55.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  33.02 
 
 
2296 aa  54.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  34.09 
 
 
1193 aa  55.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  32.12 
 
 
430 aa  55.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  30.7 
 
 
652 aa  54.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  36.05 
 
 
792 aa  54.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  30.56 
 
 
2980 aa  54.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  29.76 
 
 
662 aa  53.9  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  32.69 
 
 
1066 aa  53.5  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  32.76 
 
 
885 aa  53.5  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  24.33 
 
 
1980 aa  53.1  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  25.23 
 
 
308 aa  53.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  29.71 
 
 
1329 aa  52.8  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  29.91 
 
 
1806 aa  52.8  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  34.88 
 
 
1313 aa  52.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  30.77 
 
 
1141 aa  52  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>