31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1807 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1807  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  789    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342612 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  26.82 
 
 		 833 aa  84.3  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  25.17 
 
 		 840 aa  68.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  25.16 
 
 		 789 aa  58.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  30.47 
 
 		 757 aa  54.3  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  30.63 
 
 		 776 aa  53.1  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.9 
 
 		 712 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  30.97 
 
 		 753 aa  52.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  26.11 
 
 		 760 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.91 
 
 		 771 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.15 
 
 		 776 aa  50.4  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  22.88 
 
 		 722 aa  50.4  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  27.91 
 
 		 771 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.46 
 
 		 759 aa  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  29.57 
 
 		 739 aa  50.1  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.46 
 
 		 755 aa  49.7  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.46 
 
 		 751 aa  49.7  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.16 
 
 		 770 aa  49.7  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  27.59 
 
 		 701 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  25.69 
 
 		 750 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.91 
 
 		 772 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.89 
 
 		 755 aa  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.91 
 
 		 772 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26 
 
 		 786 aa  47.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  23.93 
 
 		 791 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  24.28 
 
 		 794 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.1 
 
 		 1362 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.44 
 
 		 795 aa  43.5  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  23.33 
 
 		 763 aa  43.5  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.66 
 
 		 671 aa  43.5  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  31.52 
 
 		 1109 aa  42.7  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>