44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3077 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3077  hypothetical protein  100 
 
 		 816 aa  1652    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  27.31 
 
 		 808 aa  188  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  26.78 
 
 		 698 aa  72  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  29.33 
 
 		 859 aa  69.3  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  21.77 
 
 		 571 aa  68.2  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  27.08 
 
 		 706 aa  65.1  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  24.56 
 
 		 708 aa  64.3  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  26.51 
 
 		 629 aa  63.9  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  28.17 
 
 		 686 aa  63.5  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  25.58 
 
 		 592 aa  63.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  27.8 
 
 		 651 aa  62.4  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  26.18 
 
 		 792 aa  62.4  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  27.8 
 
 		 651 aa  62  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  26.2 
 
 		 639 aa  61.2  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 625 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  21.65 
 
 		 709 aa  58.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  25.22 
 
 		 575 aa  57.8  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.29 
 
 		 588 aa  57.8  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.22 
 
 		 575 aa  57.8  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  26.01 
 
 		 654 aa  57.8  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  23.04 
 
 		 610 aa  57.8  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  23.25 
 
 		 613 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  24.35 
 
 		 566 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  23.69 
 
 		 640 aa  56.6  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  25.59 
 
 		 563 aa  55.1  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  23.77 
 
 		 555 aa  52.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  22.37 
 
 		 633 aa  52.8  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  24.79 
 
 		 536 aa  52.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  24.89 
 
 		 350 aa  51.6  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  21.62 
 
 		 642 aa  51.2  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  26.94 
 
 		 412 aa  51.2  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  26.18 
 
 		 500 aa  51.2  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  22.57 
 
 		 598 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  22.57 
 
 		 593 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  21.43 
 
 		 625 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  21.12 
 
 		 624 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  23.94 
 
 		 551 aa  50.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  20.18 
 
 		 613 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  21.08 
 
 		 642 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  21.08 
 
 		 627 aa  48.9  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  23.3 
 
 		 555 aa  47.8  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  21.81 
 
 		 642 aa  47.8  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  21.49 
 
 		 612 aa  45.4  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  21.89 
 
 		 621 aa  45.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>