28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2557 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2557  hypothetical protein  100 
 
 		 479 aa  971    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2322  hypothetical protein  81.53 
 
 		 457 aa  636    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0247486  hitchhiker  0.0000407236 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2064  hypothetical protein  81.29 
 
 		 457 aa  635    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000323531  hitchhiker  0.000809606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2016  hypothetical protein  81.29 
 
 		 457 aa  635    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000139386  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1781  hypothetical protein  84.22 
 
 		 455 aa  659    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000015299  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2001  hypothetical protein  81.29 
 
 		 457 aa  635    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000125665  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2364  hypothetical protein  91.37 
 
 		 394 aa  652    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000433583  hitchhiker  0.00524599 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2156  hypothetical protein  84.36 
 
 		 474 aa  717    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000672621  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2233  hypothetical protein  84.57 
 
 		 474 aa  719    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000634383  normal  0.29326 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2606  hypothetical protein  61.26 
 
 		 438 aa  535  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000605576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2203  hypothetical protein  59.48 
 
 		 445 aa  533  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000181796  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1994  hypothetical protein  63.02 
 
 		 438 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000845172  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2110  hypothetical protein  63.2 
 
 		 440 aa  496  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000434469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2017  hypothetical protein  58.74 
 
 		 440 aa  464  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1879  hypothetical protein  61.89 
 
 		 439 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00596429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2401  hypothetical protein  52.64 
 
 		 444 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000696992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2363  hypothetical protein  31.03 
 
 		 481 aa  176  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000015183  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02387  hypothetical protein  31.99 
 
 		 498 aa  173  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000501631  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2256  hypothetical protein  30.23 
 
 		 455 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147191  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1824  hypothetical protein  29.41 
 
 		 419 aa  149  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002774  hypothetical protein  29.09 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2397  hypothetical protein  29.33 
 
 		 420 aa  143  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03209  hypothetical protein  27.25 
 
 		 416 aa  127  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1059  von Willebrand factor type A  24.88 
 
 		 625 aa  67.4  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0405627  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1606  von Willebrand factor, type A  25 
 
 		 715 aa  61.6  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1355  hypothetical protein  24.31 
 
 		 787 aa  55.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1466  von Willebrand factor, type A  25.2 
 
 		 596 aa  51.6  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2528  von Willebrand factor type A  25.25 
 
 		 622 aa  45.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287943  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>