21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2528 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2528  von Willebrand factor type A  100 
 
 
622 aa  1264    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287943  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1606  von Willebrand factor, type A  28.89 
 
 
715 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1059  von Willebrand factor type A  27.23 
 
 
625 aa  152  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0405627  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1355  hypothetical protein  27.51 
 
 
787 aa  147  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1466  von Willebrand factor, type A  27.48 
 
 
596 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02387  hypothetical protein  23.41 
 
 
498 aa  63.9  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000501631  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2256  hypothetical protein  23.83 
 
 
455 aa  61.2  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147191  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2363  hypothetical protein  32.46 
 
 
481 aa  59.3  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000015183  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03209  hypothetical protein  23.41 
 
 
416 aa  55.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2017  hypothetical protein  33.61 
 
 
440 aa  54.3  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2397  hypothetical protein  21.6 
 
 
420 aa  50.4  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2606  hypothetical protein  26.92 
 
 
438 aa  50.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000605576  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1824  hypothetical protein  24.02 
 
 
419 aa  49.7  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2557  hypothetical protein  25.25 
 
 
479 aa  49.3  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2110  hypothetical protein  28.91 
 
 
440 aa  48.9  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000434469  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1879  hypothetical protein  28.7 
 
 
439 aa  48.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00596429  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1994  hypothetical protein  28.46 
 
 
438 aa  47.8  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000845172  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2401  hypothetical protein  25.22 
 
 
444 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000696992  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2064  hypothetical protein  23.27 
 
 
457 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000323531  hitchhiker  0.000809606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2156  hypothetical protein  24.19 
 
 
474 aa  44.3  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000672621  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2016  hypothetical protein  23.27 
 
 
457 aa  43.5  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000139386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>