13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1582 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1582  hypothetical protein  100 
 
 
368 aa  734    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1970  hypothetical protein  29.41 
 
 
366 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0764  hypothetical protein  33.01 
 
 
370 aa  127  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3214  hypothetical protein  32.9 
 
 
368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0827065  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2920  hypothetical protein  29.94 
 
 
374 aa  109  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479028  normal  0.0457846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0760  hypothetical protein  30.07 
 
 
388 aa  106  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2485  hypothetical protein  30.08 
 
 
408 aa  93.6  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000045173  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1371  hypothetical protein  31.01 
 
 
184 aa  74.7  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  24.56 
 
 
562 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2800  hypothetical protein  27.18 
 
 
414 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0753  hypothetical protein  25.76 
 
 
367 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0308132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1599  hypothetical protein  23.93 
 
 
398 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  23.55 
 
 
561 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>