89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1976 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  59.48 
 
 		 759 aa  893    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  59.48 
 
 		 759 aa  893    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  60.48 
 
 		 749 aa  826    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  59.53 
 
 		 773 aa  910    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 766 aa  1523    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  59.76 
 
 		 756 aa  934    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  45.03 
 
 		 757 aa  715    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  36.84 
 
 		 786 aa  432  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  34.96 
 
 		 802 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  34.72 
 
 		 785 aa  415  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  36.76 
 
 		 781 aa  415  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  35.19 
 
 		 772 aa  411  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  34.83 
 
 		 785 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  35.19 
 
 		 772 aa  411  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  31.66 
 
 		 777 aa  412  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  36.16 
 
 		 778 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  37.83 
 
 		 793 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  36.71 
 
 		 773 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  35.35 
 
 		 783 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  35.35 
 
 		 783 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  36.83 
 
 		 743 aa  379  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  33.7 
 
 		 773 aa  362  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  34.89 
 
 		 773 aa  362  1e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  35.7 
 
 		 788 aa  359  9.999999999999999e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  34.06 
 
 		 781 aa  349  1e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  30.55 
 
 		 769 aa  257  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  35.86 
 
 		 610 aa  247  6e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  34.46 
 
 		 517 aa  186  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  34.29 
 
 		 852 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  32.52 
 
 		 578 aa  179  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  36.45 
 
 		 913 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  37.88 
 
 		 805 aa  174  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  37.88 
 
 		 831 aa  174  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  34.21 
 
 		 842 aa  172  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  39.32 
 
 		 605 aa  163  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  34.18 
 
 		 607 aa  161  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  35.4 
 
 		 689 aa  159  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  35.05 
 
 		 689 aa  157  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  35.27 
 
 		 614 aa  157  9e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  33.79 
 
 		 705 aa  157  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  36.16 
 
 		 677 aa  153  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  37.55 
 
 		 644 aa  152  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  34.71 
 
 		 636 aa  152  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  29.02 
 
 		 1006 aa  151  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  33.01 
 
 		 633 aa  151  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  33 
 
 		 637 aa  150  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  29.48 
 
 		 650 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  34.29 
 
 		 631 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  34.82 
 
 		 674 aa  146  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  36.03 
 
 		 638 aa  146  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.61 
 
 		 618 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  33.02 
 
 		 637 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  36.86 
 
 		 612 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  33.44 
 
 		 612 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  32.99 
 
 		 633 aa  141  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  37.2 
 
 		 612 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  32.64 
 
 		 633 aa  139  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  37.39 
 
 		 618 aa  138  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  34.81 
 
 		 624 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  32.87 
 
 		 647 aa  134  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  35.42 
 
 		 576 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.98 
 
 		 562 aa  127  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  34.47 
 
 		 570 aa  124  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  31.16 
 
 		 645 aa  123  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  34.81 
 
 		 624 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  34.81 
 
 		 624 aa  122  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0602  von Willebrand factor type A  33.48 
 
 		 532 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  29.79 
 
 		 647 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  31.63 
 
 		 570 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  31.4 
 
 		 570 aa  113  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  31.4 
 
 		 570 aa  113  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  29.8 
 
 		 510 aa  109  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  30.92 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  30.58 
 
 		 510 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  30.58 
 
 		 510 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  30.58 
 
 		 510 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  28.86 
 
 		 519 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  30.79 
 
 		 564 aa  102  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  31.02 
 
 		 571 aa  90.9  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  30.59 
 
 		 571 aa  87.4  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  30.59 
 
 		 571 aa  87.4  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  29.12 
 
 		 552 aa  64.3  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1634  von Willebrand factor type A  26.7 
 
 		 638 aa  59.7  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233072  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0978  hypothetical protein  29.75 
 
 		 629 aa  55.8  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.827084  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1498  hypothetical protein  30.08 
 
 		 628 aa  52.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239548  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1469  hypothetical protein  30.08 
 
 		 628 aa  52.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  28.25 
 
 		 607 aa  50.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  28.65 
 
 		 2887 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  26.8 
 
 		 572 aa  44.3  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>