29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01615 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01615  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  172  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  46.84 
 
 		 633 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  43.59 
 
 		 612 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  44.3 
 
 		 627 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  44.3 
 
 		 642 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  44.3 
 
 		 642 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  44.3 
 
 		 642 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  43.04 
 
 		 621 aa  62.8  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  45.57 
 
 		 613 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  43.04 
 
 		 625 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  43.04 
 
 		 624 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  38.67 
 
 		 651 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  38.67 
 
 		 651 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  43.94 
 
 		 640 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  43.84 
 
 		 555 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  44.26 
 
 		 598 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  42.62 
 
 		 593 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  43.86 
 
 		 686 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  39.62 
 
 		 708 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  36.92 
 
 		 575 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  36.92 
 
 		 575 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  46.27 
 
 		 698 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  41.79 
 
 		 706 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  36.92 
 
 		 588 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  36.23 
 
 		 639 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  37.31 
 
 		 563 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  31.58 
 
 		 613 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  37.68 
 
 		 592 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  31.75 
 
 		 709 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>