More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1437 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1437  magnesium chelatase ATPase subunit D  100 
 
 
619 aa  1251    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000286805  normal  0.499539 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1795  magnesium chelatase ATPase subunit D  79.48 
 
 
618 aa  961    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1047  magnesium chelatase ATPase subunit D  82.23 
 
 
618 aa  1013    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  80.78 
 
 
620 aa  964    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  78.14 
 
 
621 aa  953    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  79 
 
 
618 aa  953    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1630  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  78.23 
 
 
619 aa  960    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3122  magnesium chelatase ATPase subunit D  46.52 
 
 
636 aa  450  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2540  magnesium chelatase ATPase subunit D  44.78 
 
 
608 aa  444  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2823  magnesium chelatase ATPase subunit D  44.78 
 
 
610 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00357294  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  36.3 
 
 
671 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  35.94 
 
 
664 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0209  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  36.72 
 
 
701 aa  364  2e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.910934 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0290  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  38.31 
 
 
725 aa  365  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  35.09 
 
 
677 aa  359  8e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0236  magnesium chelatase ATPase subunit D  36.9 
 
 
703 aa  355  1e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4577  magnesium chelatase ATPase subunit D  35.71 
 
 
668 aa  355  1e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03141  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  36.88 
 
 
690 aa  353  7e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.421782  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03121  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  37.67 
 
 
711 aa  351  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03111  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  37.56 
 
 
727 aa  351  2e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03211  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  37.5 
 
 
721 aa  342  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03681  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  38.7 
 
 
717 aa  342  2e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  36.67 
 
 
678 aa  341  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1654  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  38.53 
 
 
717 aa  340  5.9999999999999996e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.835262  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38488  predicted protein  33.13 
 
 
683 aa  338  9.999999999999999e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25201  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  38.53 
 
 
714 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.92 
 
 
688 aa  301  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6448  magnesium chelatase subunit D  34.5 
 
 
580 aa  296  6e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  30.35 
 
 
680 aa  288  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  31.97 
 
 
669 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  31.94 
 
 
614 aa  284  4.0000000000000003e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2084  magnesium chelatase  34.54 
 
 
617 aa  281  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191813  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1251  magnesium chelatase subunit D  33.86 
 
 
599 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045417 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_776  predicted protein  33.03 
 
 
654 aa  278  3e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.425078 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  32.84 
 
 
650 aa  273  7e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  32.56 
 
 
660 aa  266  5.999999999999999e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1694  magnesium chelatase subunit D  35.52 
 
 
590 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0775219  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  32.63 
 
 
637 aa  263  8e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  33.23 
 
 
653 aa  262  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4016  magnesium chelatase subunit D  35.18 
 
 
586 aa  260  6e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  32.65 
 
 
619 aa  258  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0486  magnesium chelatase subunit D  32.96 
 
 
605 aa  257  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3770  magnesium chelatase subunit D  35.04 
 
 
588 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804805  normal  0.0156101 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  30.1 
 
 
696 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0498  magnesium chelatase  32.92 
 
 
612 aa  244  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.141561  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  30.25 
 
 
670 aa  237  5.0000000000000005e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  30.56 
 
 
705 aa  233  7.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.1 
 
 
622 aa  232  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.1 
 
 
622 aa  232  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.1 
 
 
622 aa  232  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  32.08 
 
 
674 aa  229  8e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.81 
 
 
673 aa  223  7e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.61 
 
 
665 aa  222  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  30.43 
 
 
618 aa  222  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  27.23 
 
 
643 aa  221  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  28.95 
 
 
699 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.05 
 
 
674 aa  217  5e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.79 
 
 
653 aa  217  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  30.4 
 
 
657 aa  216  8e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3198  magnesium chelatase subunit D  32.59 
 
 
614 aa  213  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3009  magnesium chelatase subunit D  32.08 
 
 
582 aa  213  9e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247156  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  30.47 
 
 
638 aa  212  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2611  magnesium chelatase ATPase subunit D  40.7 
 
 
673 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3505  magnesium chelatase ATPase subunit D  40.7 
 
 
673 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  32.2 
 
 
719 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  39.72 
 
 
672 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2067  magnesium chelatase subunit D  31.56 
 
 
587 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.683367 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  27.88 
 
 
594 aa  188  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3503  magnesium chelatase subunit D  32.21 
 
 
573 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457147  normal  0.553977 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  35.49 
 
 
372 aa  183  9.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50740  predicted protein  36.36 
 
 
800 aa  182  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  34.97 
 
 
364 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.43 
 
 
600 aa  179  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0146  magnesium chelatase subunit D  30.26 
 
 
563 aa  176  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  36.7 
 
 
346 aa  173  7.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  33.54 
 
 
364 aa  170  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0125  magnesium chelatase  34.28 
 
 
356 aa  170  9e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00707202  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  37.32 
 
 
340 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  34.49 
 
 
351 aa  166  9e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  34.15 
 
 
309 aa  166  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  34.38 
 
 
347 aa  163  8.000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  33.64 
 
 
345 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3148  magnesium chelatase, subunit ChII, putative  37.87 
 
 
342 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  35.03 
 
 
369 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  35.46 
 
 
616 aa  162  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  33.23 
 
 
346 aa  162  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0817  Magnesium chelatase  28.6 
 
 
607 aa  160  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  31.01 
 
 
637 aa  160  6e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  35.23 
 
 
333 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  32.79 
 
 
356 aa  160  8e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1834  magnesium chelatase subunit D  36.51 
 
 
566 aa  160  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  34.84 
 
 
689 aa  160  9e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3506  magnesium chelatase  36.3 
 
 
337 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0248743  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2270  magnesium chelatase  36.3 
 
 
337 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  35.11 
 
 
357 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.29 
 
 
337 aa  158  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  30.79 
 
 
637 aa  158  3e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  34.71 
 
 
362 aa  157  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  33.81 
 
 
626 aa  157  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  34.71 
 
 
362 aa  157  6e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>