144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1068 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 
912 aa  1835    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  49.61 
 
 
1019 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  39.46 
 
 
1018 aa  452  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  42.44 
 
 
690 aa  373  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  39.74 
 
 
1780 aa  331  3e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  32.47 
 
 
1037 aa  331  4e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.9 
 
 
1146 aa  320  1e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  35.25 
 
 
1215 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  35.01 
 
 
1331 aa  307  6e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  30.21 
 
 
1059 aa  300  6e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  30.08 
 
 
1059 aa  299  2e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  28.65 
 
 
1041 aa  291  3e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.44 
 
 
697 aa  287  5.999999999999999e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  30.01 
 
 
1020 aa  266  2e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  31 
 
 
1050 aa  256  9e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  33.48 
 
 
1242 aa  242  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  25.3 
 
 
689 aa  238  5.0000000000000005e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  31.62 
 
 
619 aa  221  6e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  31.01 
 
 
756 aa  220  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  27.86 
 
 
1495 aa  214  9e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  36.39 
 
 
407 aa  207  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  38.66 
 
 
331 aa  207  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  36.02 
 
 
337 aa  200  9e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  35.75 
 
 
366 aa  200  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  36.01 
 
 
423 aa  195  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  34.82 
 
 
323 aa  193  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  35.03 
 
 
1478 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  35.11 
 
 
374 aa  187  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  37.08 
 
 
338 aa  187  7e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  34.83 
 
 
382 aa  174  7.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  32.04 
 
 
321 aa  170  9e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  32.46 
 
 
324 aa  169  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  32.27 
 
 
370 aa  167  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  32.36 
 
 
359 aa  163  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  36.14 
 
 
477 aa  162  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  30.91 
 
 
2457 aa  158  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  30.87 
 
 
491 aa  153  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  29.92 
 
 
369 aa  153  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  29.35 
 
 
837 aa  152  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  32.93 
 
 
488 aa  145  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  31.63 
 
 
678 aa  144  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  31.25 
 
 
371 aa  141  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  32.02 
 
 
474 aa  140  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  31.91 
 
 
543 aa  140  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  31.69 
 
 
503 aa  139  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  26.02 
 
 
1077 aa  137  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  25.74 
 
 
639 aa  137  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  29.5 
 
 
423 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  30.81 
 
 
457 aa  137  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  30.77 
 
 
497 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  26.97 
 
 
347 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  32.04 
 
 
389 aa  135  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  26.36 
 
 
347 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  33.14 
 
 
451 aa  131  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  30.03 
 
 
328 aa  131  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  32.36 
 
 
375 aa  131  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  31.05 
 
 
474 aa  130  9.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  30.67 
 
 
373 aa  130  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  29.89 
 
 
778 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  36.02 
 
 
815 aa  129  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.538992 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  29.74 
 
 
309 aa  127  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  31.43 
 
 
829 aa  127  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  27.45 
 
 
806 aa  127  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  32.12 
 
 
333 aa  126  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  29.27 
 
 
487 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  31.08 
 
 
317 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  30.26 
 
 
399 aa  125  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  30.72 
 
 
628 aa  125  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  32.32 
 
 
454 aa  124  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  37.75 
 
 
451 aa  124  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  31.67 
 
 
619 aa  123  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  28.44 
 
 
490 aa  123  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  30.4 
 
 
383 aa  121  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  29.94 
 
 
398 aa  120  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  31.02 
 
 
394 aa  120  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  30.4 
 
 
368 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  30.7 
 
 
1001 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  33.05 
 
 
820 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  36.76 
 
 
472 aa  119  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  31.5 
 
 
370 aa  119  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  29.88 
 
 
465 aa  119  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  28.88 
 
 
357 aa  119  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  29.72 
 
 
756 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  28.12 
 
 
495 aa  117  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  33.64 
 
 
388 aa  112  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  29.07 
 
 
364 aa  111  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  29.27 
 
 
376 aa  110  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  30.18 
 
 
457 aa  110  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  29.88 
 
 
373 aa  110  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  31.21 
 
 
401 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  26.14 
 
 
1186 aa  109  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  29.28 
 
 
357 aa  106  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  27.37 
 
 
520 aa  105  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  31.35 
 
 
392 aa  102  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  28.13 
 
 
357 aa  99.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  30.74 
 
 
370 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26810  beta-1,4-xylanase  29.43 
 
 
566 aa  95.9  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  27.62 
 
 
1247 aa  92.4  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  35.27 
 
 
955 aa  90.1  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1373  glycoside hydrolase family protein  24.03 
 
 
382 aa  88.6  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0283938 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>