142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0183 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  100 
 
 		 697 aa  1426    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  49.54 
 
 		 1037 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  43.59 
 
 		 1041 aa  564  1.0000000000000001e-159  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  43.36 
 
 		 1059 aa  549  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  43.36 
 
 		 1059 aa  549  1e-155  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  41.88 
 
 		 1020 aa  499  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  41.18 
 
 		 689 aa  498  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  67.66 
 
 		 1478 aa  480  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  31.71 
 
 		 1018 aa  338  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  35.54 
 
 		 1019 aa  325  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  45.92 
 
 		 331 aa  323  8e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  49.39 
 
 		 323 aa  315  9.999999999999999e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  48.2 
 
 		 366 aa  313  7.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  48.96 
 
 		 359 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  47.69 
 
 		 324 aa  298  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  34.92 
 
 		 756 aa  291  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  29.44 
 
 		 912 aa  287  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  42.78 
 
 		 423 aa  280  6e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  42.47 
 
 		 338 aa  273  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  35.68 
 
 		 619 aa  271  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  41.33 
 
 		 374 aa  269  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  44.24 
 
 		 321 aa  268  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  43.5 
 
 		 337 aa  263  6.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  33.14 
 
 		 690 aa  262  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  42.19 
 
 		 407 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  31.22 
 
 		 1050 aa  261  4e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  40.41 
 
 		 382 aa  241  5e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  41.88 
 
 		 347 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  41.88 
 
 		 347 aa  231  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  31.9 
 
 		 1780 aa  226  8e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  39.62 
 
 		 371 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  31.82 
 
 		 1077 aa  221  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  29.52 
 
 		 1215 aa  216  8e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  36.42 
 
 		 370 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  39.6 
 
 		 837 aa  211  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  37.86 
 
 		 369 aa  211  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  31.18 
 
 		 1495 aa  207  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  29.24 
 
 		 1331 aa  206  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  38.37 
 
 		 333 aa  206  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  40.63 
 
 		 491 aa  204  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  39.93 
 
 		 328 aa  201  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  38.78 
 
 		 399 aa  200  7.999999999999999e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.7 
 
 		 1146 aa  198  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  36.94 
 
 		 457 aa  198  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  37.92 
 
 		 474 aa  194  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  35.61 
 
 		 423 aa  193  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  36.31 
 
 		 2457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  35.96 
 
 		 477 aa  188  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  32.52 
 
 		 373 aa  185  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  36.1 
 
 		 495 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  33.33 
 
 		 389 aa  184  6e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  34.29 
 
 		 394 aa  184  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  34.23 
 
 		 678 aa  183  8.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  34.46 
 
 		 317 aa  183  8.000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  36.54 
 
 		 815 aa  182  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  35.81 
 
 		 376 aa  181  5.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  34.67 
 
 		 497 aa  179  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  34.71 
 
 		 820 aa  178  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  32.65 
 
 		 398 aa  179  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  31.59 
 
 		 806 aa  179  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  35 
 
 		 619 aa  177  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  34.08 
 
 		 490 aa  177  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  37.29 
 
 		 488 aa  176  9e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  33.94 
 
 		 487 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  35.38 
 
 		 472 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  34.83 
 
 		 778 aa  175  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  34.66 
 
 		 383 aa  175  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  35.67 
 
 		 474 aa  174  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  33.86 
 
 		 628 aa  173  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  34.08 
 
 		 829 aa  172  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  33.64 
 
 		 756 aa  172  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  35.21 
 
 		 364 aa  169  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  34.04 
 
 		 543 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  31.87 
 
 		 465 aa  168  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  36.58 
 
 		 1001 aa  167  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  32.59 
 
 		 454 aa  167  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  33.23 
 
 		 375 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  35.37 
 
 		 451 aa  166  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  33.33 
 
 		 451 aa  164  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  34.82 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  33.77 
 
 		 503 aa  161  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  33.85 
 
 		 388 aa  161  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  32.13 
 
 		 387 aa  160  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  32.89 
 
 		 370 aa  157  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  33.23 
 
 		 368 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  34.45 
 
 		 309 aa  154  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  28.28 
 
 		 1242 aa  152  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  31.63 
 
 		 463 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  33.33 
 
 		 486 aa  151  4e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  32.44 
 
 		 321 aa  150  6e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  32.11 
 
 		 370 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  31.59 
 
 		 401 aa  145  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  31.08 
 
 		 357 aa  144  7e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  33.55 
 
 		 770 aa  144  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2793  glycoside hydrolase family 10  27.96 
 
 		 561 aa  143  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0410963 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  29.97 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  30.17 
 
 		 520 aa  138  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26810  beta-1,4-xylanase  27.54 
 
 		 566 aa  134  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  31.93 
 
 		 392 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  31.29 
 
 		 357 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>