141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0372 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 		 389 aa  802    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  75.58 
 
 		 375 aa  541  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  44.76 
 
 		 371 aa  323  4e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  42.6 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  44.15 
 
 		 394 aa  291  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  43.77 
 
 		 383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  41.97 
 
 		 490 aa  280  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  43.77 
 
 		 487 aa  278  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  43.3 
 
 		 398 aa  277  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  40.81 
 
 		 678 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  45.54 
 
 		 491 aa  271  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  44.61 
 
 		 477 aa  266  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  43.73 
 
 		 376 aa  265  8e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  43.07 
 
 		 778 aa  259  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  42.39 
 
 		 474 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  43.07 
 
 		 543 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  39.88 
 
 		 837 aa  248  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  45.29 
 
 		 451 aa  246  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  37.39 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  36.81 
 
 		 347 aa  233  5e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  38.05 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  41.01 
 
 		 628 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  36.51 
 
 		 373 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  38.7 
 
 		 488 aa  223  4.9999999999999996e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  34.4 
 
 		 423 aa  220  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  38.11 
 
 		 454 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  39.76 
 
 		 495 aa  205  9e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  35.81 
 
 		 503 aa  203  4e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  36.78 
 
 		 457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  35.07 
 
 		 815 aa  196  5.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  38.92 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  38.42 
 
 		 829 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  35.92 
 
 		 474 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  35.96 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  34.3 
 
 		 366 aa  190  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  36.81 
 
 		 497 aa  189  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  36.45 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  34.78 
 
 		 472 aa  187  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  34.91 
 
 		 820 aa  186  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  36.67 
 
 		 756 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  36.26 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.33 
 
 		 697 aa  184  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  34.19 
 
 		 323 aa  182  9.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  35.71 
 
 		 1001 aa  182  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  37.39 
 
 		 457 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  33.52 
 
 		 1037 aa  179  9e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  34.03 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  33.33 
 
 		 359 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  34.99 
 
 		 1041 aa  173  5e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  33.67 
 
 		 374 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  34.56 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  34.72 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  33.04 
 
 		 370 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  31.03 
 
 		 423 aa  169  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  33.66 
 
 		 324 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  34.24 
 
 		 370 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  31.02 
 
 		 689 aa  162  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  32.43 
 
 		 1478 aa  160  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  33.67 
 
 		 1059 aa  157  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  33.67 
 
 		 1059 aa  157  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  31.07 
 
 		 465 aa  156  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  29.32 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  33.04 
 
 		 357 aa  153  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  33.13 
 
 		 1018 aa  152  8.999999999999999e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  30.67 
 
 		 321 aa  150  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  33.43 
 
 		 392 aa  149  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  34.2 
 
 		 1019 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  33.13 
 
 		 370 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  32.85 
 
 		 401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  32.67 
 
 		 1020 aa  146  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  29.02 
 
 		 486 aa  146  6e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  32.86 
 
 		 690 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  31.82 
 
 		 382 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  30.79 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  28.46 
 
 		 373 aa  143  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  30.05 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  28.74 
 
 		 364 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  29.97 
 
 		 463 aa  135  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  32.04 
 
 		 912 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  29.46 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  30.03 
 
 		 1495 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  27.87 
 
 		 357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  32.98 
 
 		 368 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  26.53 
 
 		 357 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26810  beta-1,4-xylanase  29.55 
 
 		 566 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2253  glycoside hydrolase family 10  28.61 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  28.77 
 
 		 619 aa  123  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  30.17 
 
 		 387 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1373  glycoside hydrolase family protein  29.01 
 
 		 382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0283938 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2793  glycoside hydrolase family 10  27.7 
 
 		 561 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0410963 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  32.42 
 
 		 619 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  30.26 
 
 		 1050 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2105  xylanase  29.35 
 
 		 674 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  28.53 
 
 		 756 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  25.81 
 
 		 770 aa  116  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  27.68 
 
 		 806 aa  113  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  30.3 
 
 		 639 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3662  glycoside hydrolase family protein  27.3 
 
 		 451 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132636  normal  0.859273 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3704  glycoside hydrolase family protein  26.35 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01610  beta-1,4-xylanase  28.01 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>