137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3704 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3704  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 417 aa  855    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  33.75 
 
 		 639 aa  220  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2105  xylanase  33.43 
 
 		 674 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  31.42 
 
 		 760 aa  187  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3209  glycoside hydrolase family protein  31.03 
 
 		 606 aa  177  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.818517  normal  0.245162 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1074  glycoside hydrolase family 10  32.54 
 
 		 498 aa  170  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0323  TonB-like  27.85 
 
 		 670 aa  151  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000416946  normal  0.597274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0896  glycoside hydrolase family 10  32.3 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2172  glycoside hydrolase family 10  29.53 
 
 		 482 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  26.61 
 
 		 831 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2391  Fibronectin type III domain protein  27.13 
 
 		 748 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.999424  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  24.78 
 
 		 347 aa  122  9e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  24.86 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2370  glycosy hydrolase family protein  26.37 
 
 		 457 aa  119  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249901  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0988  glycoside hydrolase family 10  26 
 
 		 975 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.661558  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  30.18 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3662  glycoside hydrolase family protein  26.14 
 
 		 451 aa  116  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132636  normal  0.859273 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  27.94 
 
 		 376 aa  116  7.999999999999999e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  26.17 
 
 		 399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  29.27 
 
 		 333 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  28.06 
 
 		 394 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  24.54 
 
 		 371 aa  112  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  27.36 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  27.05 
 
 		 477 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2724  glycoside hydrolase family 10  25.06 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.85294  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  25.98 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  25.68 
 
 		 490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0153  glycoside hydrolase family 10  23.82 
 
 		 428 aa  111  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  24.07 
 
 		 423 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  24.01 
 
 		 487 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0181  Beta-1 4-xylanase-like  27.52 
 
 		 574 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  29.43 
 
 		 368 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01610  beta-1,4-xylanase  24.22 
 
 		 415 aa  106  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  25.17 
 
 		 756 aa  106  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  26.35 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  27.59 
 
 		 474 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  25.9 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  26.19 
 
 		 497 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  24.35 
 
 		 366 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  25.55 
 
 		 541 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  24.92 
 
 		 820 aa  103  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2048  glycoside hydrolase family 10  25.81 
 
 		 433 aa  103  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.900928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  26.64 
 
 		 837 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  27.11 
 
 		 503 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  24.84 
 
 		 472 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  25.7 
 
 		 678 aa  100  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  27.22 
 
 		 328 aa  100  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0012  glycoside hydrolase family 10  25.5 
 
 		 417 aa  99  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.577284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  24.22 
 
 		 778 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  28.43 
 
 		 457 aa  97.1  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  25.21 
 
 		 374 aa  96.7  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  26.69 
 
 		 1186 aa  96.3  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  29.79 
 
 		 997 aa  96.3  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  24.52 
 
 		 474 aa  95.5  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  25.08 
 
 		 1001 aa  95.9  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20470  beta-1,4-xylanase  26.75 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  26.4 
 
 		 543 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  26.62 
 
 		 628 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  25.72 
 
 		 829 aa  95.1  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  24.39 
 
 		 488 aa  95.1  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  26.39 
 
 		 457 aa  94  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  28.94 
 
 		 317 aa  94  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  24.73 
 
 		 619 aa  93.6  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  28.78 
 
 		 451 aa  93.2  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  25.35 
 
 		 309 aa  93.2  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  26.85 
 
 		 373 aa  93.2  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  23 
 
 		 369 aa  92  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  25.84 
 
 		 323 aa  92  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  23.76 
 
 		 815 aa  90.9  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  25.94 
 
 		 491 aa  90.5  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  24.32 
 
 		 454 aa  89.7  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1433  glycoside hydrolase family 10  25.46 
 
 		 433 aa  89.7  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.43821  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3590  glycoside hydrolase family protein  27.62 
 
 		 325 aa  89.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.013688  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  27.14 
 
 		 401 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03861  glycosyl hydrolase family 10  29.15 
 
 		 325 aa  87  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260596  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  23.13 
 
 		 370 aa  87  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  23.92 
 
 		 495 aa  87  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  28.33 
 
 		 1037 aa  86.3  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  23.13 
 
 		 451 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  25.63 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  26.69 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  25.16 
 
 		 463 aa  84.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  24.83 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  24.59 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  30.45 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  28.15 
 
 		 1019 aa  82.8  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  21.43 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  23.03 
 
 		 689 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2793  glycoside hydrolase family 10  24.18 
 
 		 561 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0410963 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  24.36 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26810  beta-1,4-xylanase  24.26 
 
 		 566 aa  80.5  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  26.71 
 
 		 690 aa  80.1  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  24.48 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  24.53 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  27.87 
 
 		 721 aa  77.4  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  27.01 
 
 		 1041 aa  77  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  23.08 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  25.8 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  24.41 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  24.83 
 
 		 1018 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>