127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2172 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2172  glycoside hydrolase family 10  100 
 
 		 482 aa  969    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2391  Fibronectin type III domain protein  42.37 
 
 		 748 aa  311  2e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.999424  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  40.33 
 
 		 831 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0988  glycoside hydrolase family 10  36.46 
 
 		 975 aa  291  1e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.661558  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1074  glycoside hydrolase family 10  36.75 
 
 		 498 aa  244  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3209  glycoside hydrolase family protein  32.86 
 
 		 606 aa  195  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.818517  normal  0.245162 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0323  TonB-like  31.22 
 
 		 670 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000416946  normal  0.597274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0896  glycoside hydrolase family 10  32.93 
 
 		 434 aa  183  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  28.71 
 
 		 639 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  30.49 
 
 		 760 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2105  xylanase  28.82 
 
 		 674 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3704  glycoside hydrolase family protein  29.53 
 
 		 417 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1433  glycoside hydrolase family 10  28.73 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.43821  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2370  glycosy hydrolase family protein  23.57 
 
 		 457 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249901  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3662  glycoside hydrolase family protein  26.54 
 
 		 451 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132636  normal  0.859273 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01610  beta-1,4-xylanase  26.65 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2724  glycoside hydrolase family 10  25.06 
 
 		 408 aa  100  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.85294  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  30.18 
 
 		 371 aa  97.1  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  24.53 
 
 		 837 aa  95.5  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20470  beta-1,4-xylanase  27.72 
 
 		 399 aa  93.2  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  27.78 
 
 		 347 aa  89  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0012  glycoside hydrolase family 10  25.33 
 
 		 417 aa  88.2  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.577284 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  28.85 
 
 		 333 aa  87.8  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  27.12 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0153  glycoside hydrolase family 10  24.94 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2369  glycosy hydrolase family protein  24.29 
 
 		 1014 aa  83.6  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  25.79 
 
 		 1041 aa  81.6  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  25.07 
 
 		 543 aa  81.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  26.75 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  26.42 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  27.39 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  27.69 
 
 		 399 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  28.33 
 
 		 323 aa  79.7  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  24.62 
 
 		 678 aa  78.6  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  28.2 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  29.92 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  26.3 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  28.25 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  26.05 
 
 		 457 aa  76.6  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  27.04 
 
 		 383 aa  75.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  26.52 
 
 		 1037 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  24.77 
 
 		 486 aa  74.3  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  28.68 
 
 		 1020 aa  73.6  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  24.38 
 
 		 497 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  24.83 
 
 		 820 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  26.52 
 
 		 474 aa  73.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2048  glycoside hydrolase family 10  25.93 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.900928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  25.22 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0181  Beta-1 4-xylanase-like  32.22 
 
 		 574 aa  70.1  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  25 
 
 		 1059 aa  70.1  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  25 
 
 		 1059 aa  70.1  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  24.77 
 
 		 756 aa  69.3  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  27.61 
 
 		 389 aa  69.7  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  27.36 
 
 		 1018 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  24.34 
 
 		 495 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  26.21 
 
 		 477 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  25.49 
 
 		 689 aa  68.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  25.72 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  25.71 
 
 		 338 aa  69.3  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  25.29 
 
 		 474 aa  68.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  25.91 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  30.23 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  23.9 
 
 		 487 aa  67.8  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  25 
 
 		 491 aa  67  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  24.7 
 
 		 490 aa  67  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  26.61 
 
 		 324 aa  67  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  26.88 
 
 		 337 aa  66.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  25.6 
 
 		 331 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  26.14 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1373  glycoside hydrolase family protein  23.83 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0283938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  25.32 
 
 		 829 aa  63.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  23.32 
 
 		 628 aa  63.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  24.7 
 
 		 815 aa  63.2  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  24.86 
 
 		 370 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  25.45 
 
 		 364 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  24.57 
 
 		 328 aa  63.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  25.44 
 
 		 309 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  23.99 
 
 		 806 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  26.07 
 
 		 1050 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  24.9 
 
 		 778 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  24.01 
 
 		 503 aa  62.4  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  25.24 
 
 		 472 aa  62  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  23.51 
 
 		 488 aa  61.6  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  30.82 
 
 		 541 aa  60.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  22.96 
 
 		 520 aa  60.1  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  23.68 
 
 		 465 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  25.4 
 
 		 1001 aa  59.7  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  26.67 
 
 		 1478 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  25.56 
 
 		 321 aa  59.3  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.55 
 
 		 697 aa  58.9  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  22.94 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  25 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  25.44 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  24.37 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  22.49 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  24.68 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  24.29 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26810  beta-1,4-xylanase  24 
 
 		 566 aa  57  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  24.37 
 
 		 1019 aa  57  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  24.38 
 
 		 357 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>