More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4962 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  100 
 
 		 778 aa  1543    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  66.94 
 
 		 490 aa  511  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  69.48 
 
 		 678 aa  504  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  65.2 
 
 		 487 aa  485  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  51.83 
 
 		 491 aa  353  7e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  52.01 
 
 		 474 aa  350  5e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  46.37 
 
 		 477 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  47.66 
 
 		 371 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  45.41 
 
 		 488 aa  309  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  48.15 
 
 		 451 aa  306  9.000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  40.11 
 
 		 373 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  46.52 
 
 		 543 aa  282  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  40.66 
 
 		 503 aa  281  3e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  42.54 
 
 		 495 aa  272  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  69.06 
 
 		 688 aa  269  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  43.89 
 
 		 497 aa  266  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  43.47 
 
 		 474 aa  262  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  40.35 
 
 		 347 aa  261  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  39.11 
 
 		 423 aa  260  7e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  40.06 
 
 		 347 aa  260  7e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  43.07 
 
 		 389 aa  260  8e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  43.22 
 
 		 820 aa  257  7e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  43.2 
 
 		 375 aa  256  8e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  44.44 
 
 		 829 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  43.32 
 
 		 454 aa  254  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  37.19 
 
 		 628 aa  254  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  39.56 
 
 		 837 aa  254  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  68.98 
 
 		 1176 aa  252  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  43.17 
 
 		 815 aa  252  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  44.24 
 
 		 1001 aa  252  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  43.71 
 
 		 756 aa  251  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  46.89 
 
 		 457 aa  250  9e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  45.07 
 
 		 309 aa  249  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  40.88 
 
 		 472 aa  248  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  40.82 
 
 		 376 aa  243  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  36.34 
 
 		 399 aa  241  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  70.59 
 
 		 494 aa  241  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  44.12 
 
 		 451 aa  237  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  75.39 
 
 		 518 aa  234  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  39.25 
 
 		 457 aa  231  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  39.25 
 
 		 383 aa  230  7e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  39.48 
 
 		 321 aa  228  4e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  36.54 
 
 		 394 aa  226  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  37.46 
 
 		 398 aa  225  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  38.17 
 
 		 333 aa  223  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  39.37 
 
 		 370 aa  222  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  38.11 
 
 		 366 aa  213  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  33.44 
 
 		 323 aa  192  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  37.29 
 
 		 359 aa  191  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  32.03 
 
 		 373 aa  186  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  36.2 
 
 		 324 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07401  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  34.29 
 
 		 355 aa  181  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  34.83 
 
 		 328 aa  180  8e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  34.34 
 
 		 370 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  33.62 
 
 		 689 aa  177  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.48 
 
 		 697 aa  177  9e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  33.16 
 
 		 1478 aa  174  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  32.93 
 
 		 1041 aa  173  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  35.05 
 
 		 338 aa  171  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  32.1 
 
 		 1037 aa  170  9e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  33.86 
 
 		 1019 aa  168  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  34.59 
 
 		 423 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  35.02 
 
 		 331 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  32.49 
 
 		 317 aa  165  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  32.48 
 
 		 357 aa  163  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2253  glycoside hydrolase family 10  31.97 
 
 		 381 aa  161  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  33.24 
 
 		 374 aa  161  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  30.41 
 
 		 465 aa  159  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  31.34 
 
 		 357 aa  158  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  36.36 
 
 		 619 aa  158  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  31.42 
 
 		 357 aa  157  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  29.09 
 
 		 369 aa  154  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  30.15 
 
 		 486 aa  152  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  32.9 
 
 		 407 aa  150  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  30.99 
 
 		 1018 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  29.01 
 
 		 337 aa  147  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  31.52 
 
 		 1050 aa  146  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  32.63 
 
 		 690 aa  146  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  30.56 
 
 		 321 aa  146  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  30.52 
 
 		 1059 aa  144  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  29.53 
 
 		 401 aa  145  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  30.1 
 
 		 387 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  30.52 
 
 		 1059 aa  144  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  32.91 
 
 		 1020 aa  140  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  28.57 
 
 		 1495 aa  139  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  39.58 
 
 		 1548 aa  138  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  48.91 
 
 		 794 aa  138  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0624872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  30.94 
 
 		 388 aa  138  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  29.67 
 
 		 463 aa  138  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  32.99 
 
 		 368 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  26.82 
 
 		 364 aa  138  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  33.45 
 
 		 370 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  63.46 
 
 		 935 aa  137  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  30.03 
 
 		 382 aa  136  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  64.36 
 
 		 376 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  51.53 
 
 		 727 aa  134  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.79 
 
 		 1146 aa  132  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  27.13 
 
 		 770 aa  131  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  29.89 
 
 		 912 aa  130  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  33.46 
 
 		 392 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>