227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2745 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  100 
 
 		 376 aa  740    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  65.35 
 
 		 688 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  65.35 
 
 		 518 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  64.36 
 
 		 727 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  64.36 
 
 		 778 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  57.43 
 
 		 494 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  59 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  55 
 
 		 436 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  55.88 
 
 		 935 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  51.49 
 
 		 998 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  50.94 
 
 		 775 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  49.04 
 
 		 880 aa  106  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  52.94 
 
 		 979 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  46.53 
 
 		 487 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  51.46 
 
 		 1007 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  50.5 
 
 		 767 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  54.95 
 
 		 938 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  47.93 
 
 		 488 aa  99.4  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  48.51 
 
 		 442 aa  99.4  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  44 
 
 		 875 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  47.52 
 
 		 423 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  48.51 
 
 		 743 aa  97.4  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  47.52 
 
 		 533 aa  96.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  44.55 
 
 		 589 aa  97.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  48.11 
 
 		 785 aa  96.7  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  50 
 
 		 851 aa  95.9  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  49 
 
 		 596 aa  95.1  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  49 
 
 		 432 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  44.55 
 
 		 489 aa  94.4  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  43.4 
 
 		 436 aa  94  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.1 
 
 		 984 aa  94  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  48.39 
 
 		 474 aa  94  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  44.55 
 
 		 620 aa  94  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  44.66 
 
 		 934 aa  94  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  44 
 
 		 588 aa  93.6  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  47.52 
 
 		 623 aa  93.2  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  44.55 
 
 		 611 aa  92.8  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  48.91 
 
 		 1209 aa  92.8  9e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  42.62 
 
 		 963 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  47.06 
 
 		 773 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  45 
 
 		 590 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  49.45 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  49.45 
 
 		 763 aa  90.9  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  45 
 
 		 966 aa  90.9  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  47.52 
 
 		 842 aa  90.9  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  46.53 
 
 		 681 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  44.66 
 
 		 487 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  39.01 
 
 		 486 aa  89.4  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  47.06 
 
 		 925 aa  89.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  46 
 
 		 420 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  44.12 
 
 		 812 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  41.58 
 
 		 628 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  44.14 
 
 		 744 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  45.54 
 
 		 429 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  43.93 
 
 		 864 aa  87  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  51.85 
 
 		 1137 aa  85.9  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  42.16 
 
 		 913 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  44.55 
 
 		 990 aa  85.5  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  50.59 
 
 		 1298 aa  84.7  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  43.14 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  44.76 
 
 		 499 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  44.12 
 
 		 580 aa  84.3  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  38.68 
 
 		 609 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  42.57 
 
 		 488 aa  84.3  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  48.15 
 
 		 460 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  43.16 
 
 		 448 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  44.12 
 
 		 794 aa  83.2  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  45.05 
 
 		 460 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  43 
 
 		 669 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  42.39 
 
 		 562 aa  82.4  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  43.14 
 
 		 854 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  42.45 
 
 		 846 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  42.16 
 
 		 906 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  46.15 
 
 		 743 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  47.06 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  41.18 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  47.12 
 
 		 894 aa  80.9  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  39.05 
 
 		 1128 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  43.14 
 
 		 774 aa  80.1  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  48.15 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  42.53 
 
 		 456 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  43.88 
 
 		 495 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  42.57 
 
 		 746 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  38.24 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  41.58 
 
 		 633 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  39 
 
 		 894 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  42.86 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  41.82 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  42 
 
 		 493 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  42.57 
 
 		 543 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  45.83 
 
 		 449 aa  76.3  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  40.78 
 
 		 690 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  48.19 
 
 		 477 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  40.59 
 
 		 605 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  48.28 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  41.51 
 
 		 942 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  40.78 
 
 		 854 aa  74.7  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  37.04 
 
 		 491 aa  74.3  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  43.27 
 
 		 719 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  50 
 
 		 933 aa  73.9  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>