214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2656 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  64.71 
 
 		 596 aa  707    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  100 
 
 		 611 aa  1243    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  58.02 
 
 		 620 aa  669    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  57.95 
 
 		 589 aa  674    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  72.58 
 
 		 767 aa  654    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  54.75 
 
 		 588 aa  622  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  54.49 
 
 		 590 aa  617  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  51.67 
 
 		 605 aa  590  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2947  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  61.57 
 
 		 452 aa  529  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000458427  hitchhiker  0.00017321 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  53.96 
 
 		 1128 aa  471  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  55.5 
 
 		 655 aa  468  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  54.17 
 
 		 646 aa  456  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  53.81 
 
 		 623 aa  451  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  54.27 
 
 		 791 aa  444  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  49.77 
 
 		 548 aa  420  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  49.53 
 
 		 572 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  51.28 
 
 		 1209 aa  412  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  48.15 
 
 		 639 aa  402  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0598  cellulase  45.71 
 
 		 628 aa  386  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.120048  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.91 
 
 		 633 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  41.69 
 
 		 743 aa  320  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  34.77 
 
 		 393 aa  216  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.951317 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  34.13 
 
 		 450 aa  197  6e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  28.62 
 
 		 459 aa  158  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  55.81 
 
 		 979 aa  153  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  28.82 
 
 		 469 aa  137  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  56.64 
 
 		 785 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  58.56 
 
 		 488 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  48.61 
 
 		 998 aa  127  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  26.44 
 
 		 446 aa  120  9e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  53.7 
 
 		 744 aa  118  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  44.9 
 
 		 743 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  43.61 
 
 		 669 aa  115  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  53.47 
 
 		 393 aa  113  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  41.67 
 
 		 966 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  44.72 
 
 		 963 aa  111  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  52.43 
 
 		 681 aa  110  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  50 
 
 		 880 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.79 
 
 		 491 aa  105  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0135  cellulase  27.34 
 
 		 469 aa  101  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  40.46 
 
 		 479 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  33.9 
 
 		 455 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5837  cellulase  27.75 
 
 		 341 aa  99  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0236  glycoside hydrolase family 6  28.5 
 
 		 501 aa  98.6  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  43.27 
 
 		 990 aa  98.2  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  46.67 
 
 		 775 aa  97.8  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  42.4 
 
 		 974 aa  97.8  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  42.18 
 
 		 1007 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  46.53 
 
 		 597 aa  95.9  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  40.94 
 
 		 1055 aa  95.9  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  44.74 
 
 		 499 aa  95.5  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  45.19 
 
 		 690 aa  95.5  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  48.04 
 
 		 489 aa  94.7  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  42.24 
 
 		 727 aa  94.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  45.1 
 
 		 875 aa  93.6  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  30.91 
 
 		 633 aa  93.2  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  45.19 
 
 		 854 aa  93.6  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  44.12 
 
 		 376 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  43.69 
 
 		 778 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1738  glycoside hydrolase family 6  27.89 
 
 		 419 aa  92.8  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304195  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  30.23 
 
 		 773 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  47.17 
 
 		 774 aa  91.7  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5296  hypothetical protein  39.6 
 
 		 385 aa  90.5  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  44.34 
 
 		 420 aa  90.5  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  32.32 
 
 		 486 aa  90.9  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  47.57 
 
 		 580 aa  89.7  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  43.93 
 
 		 894 aa  89.7  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  41.12 
 
 		 746 aa  89  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  42.06 
 
 		 719 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  41.27 
 
 		 533 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  43.14 
 
 		 934 aa  89.4  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  41.51 
 
 		 812 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  42.57 
 
 		 436 aa  89.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  46.15 
 
 		 681 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.06 
 
 		 984 aa  87.8  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  37.76 
 
 		 439 aa  87.4  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  45.36 
 
 		 485 aa  87.4  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  42.72 
 
 		 494 aa  87.4  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1003  cellulase  26.92 
 
 		 330 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  41.9 
 
 		 423 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  41.75 
 
 		 794 aa  85.9  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  43.69 
 
 		 851 aa  85.5  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5301  cellulase  26.95 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.104046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5390  cellulase  26.95 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.217743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5680  cellulase  26.95 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  38.83 
 
 		 688 aa  85.1  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  28.97 
 
 		 854 aa  84.7  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  40.35 
 
 		 699 aa  84.3  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  53.1 
 
 		 829 aa  83.2  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  38.89 
 
 		 609 aa  83.2  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  41.18 
 
 		 842 aa  83.6  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  40 
 
 		 495 aa  83.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  42.57 
 
 		 442 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  50 
 
 		 938 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  41.44 
 
 		 679 aa  82.8  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  42.55 
 
 		 598 aa  82  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  36.89 
 
 		 518 aa  81.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  42.31 
 
 		 913 aa  81.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  38.24 
 
 		 894 aa  80.9  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  42.45 
 
 		 942 aa  80.9  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>