218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2272 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  100 
 
 		 791 aa  1566    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  45.38 
 
 		 1128 aa  514  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  38.47 
 
 		 767 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  45.02 
 
 		 611 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  52.34 
 
 		 655 aa  442  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  43.9 
 
 		 596 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  51.28 
 
 		 623 aa  433  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  50.69 
 
 		 646 aa  416  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  48.49 
 
 		 572 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  49.05 
 
 		 620 aa  405  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2947  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  49.32 
 
 		 452 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000458427  hitchhiker  0.00017321 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  48.94 
 
 		 588 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  48.49 
 
 		 1209 aa  396  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  48.59 
 
 		 589 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  48.6 
 
 		 590 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  46.36 
 
 		 605 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0598  cellulase  43.27 
 
 		 628 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.120048  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  45.45 
 
 		 548 aa  363  5.0000000000000005e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.42 
 
 		 639 aa  361  3e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  36.35 
 
 		 633 aa  354  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  42.76 
 
 		 743 aa  332  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  33.41 
 
 		 393 aa  174  5.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.951317 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  35.67 
 
 		 450 aa  160  8e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  57.02 
 
 		 619 aa  133  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  60.82 
 
 		 867 aa  120  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0650  RhoGEF guanine nucleotide exchange factor for Rho/Rac/Cdc42-like GTPases-like  53.85 
 
 		 558 aa  118  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.75821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  59.6 
 
 		 561 aa  116  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  58.59 
 
 		 436 aa  114  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  52.69 
 
 		 511 aa  107  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0569  hypothetical protein  51.55 
 
 		 781 aa  104  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.220084 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  32.93 
 
 		 1055 aa  104  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  46.73 
 
 		 621 aa  99.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  58.06 
 
 		 725 aa  100  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  48.42 
 
 		 933 aa  97.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  49.53 
 
 		 746 aa  86.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  43.16 
 
 		 700 aa  81.6  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  46.15 
 
 		 460 aa  80.5  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0236  glycoside hydrolase family 6  27.69 
 
 		 501 aa  79.3  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  29.79 
 
 		 1194 aa  80.1  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  48.28 
 
 		 913 aa  79  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  43.52 
 
 		 727 aa  78.2  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0135  cellulase  26.41 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  48.15 
 
 		 880 aa  77.8  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.51 
 
 		 984 aa  75.9  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  38.93 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  44.21 
 
 		 763 aa  75.5  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  43.27 
 
 		 681 aa  75.5  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  36.05 
 
 		 773 aa  75.1  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  43.4 
 
 		 934 aa  75.1  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  45.26 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  41.58 
 
 		 925 aa  73.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  44.68 
 
 		 842 aa  73.9  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  46.34 
 
 		 436 aa  72.8  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  44.79 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  44.55 
 
 		 688 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  47.56 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  47.06 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  43.14 
 
 		 518 aa  72  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  41.18 
 
 		 775 aa  71.6  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  40 
 
 		 488 aa  71.2  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  38.24 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  46.25 
 
 		 1137 aa  71.2  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  43.14 
 
 		 812 aa  71.2  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2939  ATPase  35 
 
 		 787 aa  70.9  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  43.14 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  45.56 
 
 		 460 aa  70.1  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.9 
 
 		 998 aa  70.1  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  43.53 
 
 		 1298 aa  69.7  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  42.57 
 
 		 778 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  41.41 
 
 		 487 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  45.71 
 
 		 854 aa  69.3  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  40.4 
 
 		 906 aa  70.1  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  36.73 
 
 		 364 aa  69.3  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  37.88 
 
 		 366 aa  69.3  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  39.33 
 
 		 914 aa  68.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  36.57 
 
 		 669 aa  68.9  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  37.11 
 
 		 491 aa  68.6  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  30.28 
 
 		 455 aa  68.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  34.58 
 
 		 637 aa  68.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  46.15 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  43.88 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  24.28 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  44.66 
 
 		 609 aa  67.8  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  42.05 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  42.05 
 
 		 422 aa  67  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  39.05 
 
 		 420 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1738  glycoside hydrolase family 6  25.81 
 
 		 419 aa  66.6  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304195  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  39.5 
 
 		 1007 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  42.31 
 
 		 846 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  44.83 
 
 		 938 aa  65.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  38.68 
 
 		 990 aa  65.5  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  38.05 
 
 		 743 aa  65.9  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  31.37 
 
 		 864 aa  65.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  36.78 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  35.64 
 
 		 774 aa  64.3  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  40.23 
 
 		 744 aa  64.3  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  36 
 
 		 479 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  36.42 
 
 		 633 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  38.24 
 
 		 628 aa  63.9  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  39.29 
 
 		 353 aa  63.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>