248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3120 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  100 
 
 		 439 aa  863    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  44.06 
 
 		 420 aa  286  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3536  cellulose-binding family II  61.84 
 
 		 389 aa  283  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0870492  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  37.87 
 
 		 842 aa  278  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1699  hypothetical protein  50 
 
 		 355 aa  219  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  40.43 
 
 		 620 aa  96.7  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  38.46 
 
 		 589 aa  93.6  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.97 
 
 		 979 aa  93.2  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  48.51 
 
 		 854 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  33.48 
 
 		 854 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  48.51 
 
 		 690 aa  91.3  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  42 
 
 		 393 aa  90.9  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  46.53 
 
 		 646 aa  89.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  45 
 
 		 489 aa  88.6  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  40.68 
 
 		 785 aa  87  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  37.04 
 
 		 590 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  28.71 
 
 		 773 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  40 
 
 		 623 aa  85.5  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  39.39 
 
 		 588 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  40.2 
 
 		 934 aa  84.7  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  39.66 
 
 		 767 aa  83.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  40 
 
 		 842 aa  83.6  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  33.72 
 
 		 455 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  46.24 
 
 		 449 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  31.8 
 
 		 633 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  41.35 
 
 		 913 aa  81.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  44.12 
 
 		 778 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  36.42 
 
 		 613 aa  80.9  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  40.59 
 
 		 688 aa  80.1  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  43.69 
 
 		 727 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  37.38 
 
 		 812 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  42.42 
 
 		 597 aa  78.2  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  42.16 
 
 		 775 aa  77.8  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  36.04 
 
 		 1128 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  42.57 
 
 		 990 aa  78.2  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  34.36 
 
 		 486 aa  77.8  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  34.06 
 
 		 669 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  38.61 
 
 		 518 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  38.21 
 
 		 894 aa  76.6  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  40.78 
 
 		 774 aa  76.6  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  42.86 
 
 		 494 aa  76.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  38.61 
 
 		 596 aa  75.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.83 
 
 		 998 aa  76.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  39 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  41.86 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  37.84 
 
 		 743 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  33.65 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  41.38 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.62 
 
 		 984 aa  74.3  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  36 
 
 		 846 aa  74.3  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  38.24 
 
 		 487 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  42.11 
 
 		 477 aa  73.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  32 
 
 		 966 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  39.05 
 
 		 851 aa  73.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  37.07 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  35.09 
 
 		 875 aa  73.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  35.04 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  34.27 
 
 		 611 aa  73.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  36 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  32 
 
 		 609 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  43.4 
 
 		 719 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  39 
 
 		 580 aa  70.9  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  40.86 
 
 		 460 aa  71.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  34.65 
 
 		 628 aa  70.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  34.56 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  47.62 
 
 		 490 aa  70.9  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  41.18 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  33.66 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  38.24 
 
 		 880 aa  70.5  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  47.62 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  30.37 
 
 		 963 aa  70.5  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  33.82 
 
 		 744 aa  70.5  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  40.45 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  37 
 
 		 488 aa  69.7  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  29.77 
 
 		 1055 aa  68.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  44.19 
 
 		 702 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  31.85 
 
 		 619 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  35.29 
 
 		 681 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  39.36 
 
 		 474 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  32.52 
 
 		 637 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  36.45 
 
 		 491 aa  68.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  31.62 
 
 		 725 aa  67.8  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  37 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  35.29 
 
 		 694 aa  67  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  42.5 
 
 		 847 aa  67  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  35.64 
 
 		 906 aa  66.6  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  35.16 
 
 		 700 aa  66.6  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  36.46 
 
 		 485 aa  66.6  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  41.86 
 
 		 756 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  34.31 
 
 		 469 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  51.19 
 
 		 778 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  35.64 
 
 		 389 aa  66.2  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  33.03 
 
 		 488 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  36.54 
 
 		 925 aa  65.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  37 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  36.89 
 
 		 487 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  40.79 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  37.32 
 
 		 605 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  33.64 
 
 		 746 aa  65.1  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  42.98 
 
 		 829 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>