238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2811 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 478 aa  944    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  55.26 
 
 		 453 aa  448  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  52.69 
 
 		 460 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  49.67 
 
 		 445 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  47.26 
 
 		 449 aa  401  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  49.39 
 
 		 523 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  44.93 
 
 		 468 aa  357  2.9999999999999997e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  53.42 
 
 		 543 aa  350  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2228  glycoside hydrolase family 5  50.31 
 
 		 403 aa  310  2.9999999999999997e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  46.97 
 
 		 561 aa  298  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  48.53 
 
 		 1294 aa  295  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  47.17 
 
 		 1414 aa  295  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0656  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.96 
 
 		 507 aa  294  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  53.82 
 
 		 1369 aa  293  5e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  30.32 
 
 		 558 aa  131  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  61.46 
 
 		 490 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  26.8 
 
 		 732 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  54.13 
 
 		 702 aa  105  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  55.67 
 
 		 545 aa  98.6  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  46.32 
 
 		 446 aa  93.6  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  53.68 
 
 		 854 aa  91.3  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  44.44 
 
 		 456 aa  87.8  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  38.56 
 
 		 846 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  51.02 
 
 		 673 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1029  cellulose-binding family II  38.36 
 
 		 792 aa  85.9  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.746729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  47.31 
 
 		 774 aa  84.7  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  46.59 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  42.27 
 
 		 477 aa  83.2  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  44.14 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  50.54 
 
 		 543 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  50 
 
 		 690 aa  80.9  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  50 
 
 		 854 aa  80.5  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  46.73 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  40.12 
 
 		 756 aa  79.7  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  48.84 
 
 		 646 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  44.33 
 
 		 474 aa  79  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.15 
 
 		 998 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  47.92 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  43.24 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  38.36 
 
 		 694 aa  77.8  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  51.72 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  46.88 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  42.42 
 
 		 744 aa  77.4  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  44.85 
 
 		 942 aa  77  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  43.96 
 
 		 743 aa  76.6  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  44.68 
 
 		 681 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2541  hypothetical protein  28.12 
 
 		 850 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.241024  hitchhiker  0.000170859 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  40.37 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 493 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  44.79 
 
 		 678 aa  75.1  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  45.56 
 
 		 820 aa  74.3  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  39.81 
 
 		 488 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  44.79 
 
 		 656 aa  72.8  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  36.61 
 
 		 847 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  42.68 
 
 		 681 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  45.05 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  31.78 
 
 		 609 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  40.62 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  34.15 
 
 		 474 aa  71.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  51.16 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  42.71 
 
 		 613 aa  71.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  47.13 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  47.95 
 
 		 829 aa  70.9  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  45.35 
 
 		 623 aa  70.5  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  46.43 
 
 		 597 aa  70.1  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  46.15 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  42.45 
 
 		 499 aa  70.1  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  44.3 
 
 		 669 aa  69.7  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  39.8 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  39.62 
 
 		 851 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  42.86 
 
 		 353 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  48.65 
 
 		 532 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  40 
 
 		 485 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  42.27 
 
 		 842 aa  68.2  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  43.33 
 
 		 611 aa  68.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  34.51 
 
 		 812 aa  68.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  36.73 
 
 		 593 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  39.8 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  35.42 
 
 		 479 aa  67  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  48.84 
 
 		 990 aa  66.6  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  35.05 
 
 		 925 aa  66.6  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  39.53 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  43.88 
 
 		 2310 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  34.95 
 
 		 620 aa  65.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  41.46 
 
 		 488 aa  65.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4134  cellulose-binding family II  47.13 
 
 		 536 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  46.59 
 
 		 719 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  44.19 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  36.46 
 
 		 746 aa  65.1  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  39.29 
 
 		 589 aa  65.1  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  35.11 
 
 		 486 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  40.23 
 
 		 913 aa  65.1  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  39.13 
 
 		 468 aa  64.3  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  39.33 
 
 		 495 aa  64.7  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  42.17 
 
 		 767 aa  64.3  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  44.33 
 
 		 655 aa  63.9  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  38.14 
 
 		 580 aa  64.3  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  36.73 
 
 		 773 aa  64.3  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  27.64 
 
 		 469 aa  63.5  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  33.33 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>