295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1959 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  100 
 
 		 984 aa  2014    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  56.77 
 
 		 1904 aa  721    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  52.17 
 
 		 919 aa  649    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  56.92 
 
 		 1759 aa  722    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  60.19 
 
 		 974 aa  1177    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  59.57 
 
 		 842 aa  768    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  58.53 
 
 		 900 aa  741    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  53.92 
 
 		 854 aa  710    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  57.16 
 
 		 854 aa  728    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  56.92 
 
 		 1478 aa  724    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  65.33 
 
 		 894 aa  1012    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  57.81 
 
 		 1121 aa  748    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  52.61 
 
 		 963 aa  954    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  57.17 
 
 		 979 aa  1064    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  59.53 
 
 		 973 aa  790    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  54.32 
 
 		 722 aa  668    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  53.23 
 
 		 966 aa  961    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  61.05 
 
 		 785 aa  800    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  51.93 
 
 		 741 aa  631  1e-179  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  49.03 
 
 		 938 aa  608  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  45.26 
 
 		 767 aa  224  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  47.45 
 
 		 1128 aa  127  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  45.33 
 
 		 633 aa  125  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  48.15 
 
 		 486 aa  119  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  54.29 
 
 		 775 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  51.96 
 
 		 778 aa  115  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  43.36 
 
 		 605 aa  115  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  48.8 
 
 		 533 aa  115  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  50.98 
 
 		 688 aa  115  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  55.24 
 
 		 609 aa  115  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  54.81 
 
 		 596 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.43 
 
 		 491 aa  114  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  42.68 
 
 		 842 aa  114  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  57.45 
 
 		 938 aa  114  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  54.37 
 
 		 588 aa  112  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  47.06 
 
 		 1055 aa  111  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  50.98 
 
 		 623 aa  111  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  50.98 
 
 		 628 aa  111  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  50 
 
 		 518 aa  111  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  43.61 
 
 		 773 aa  111  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  47.24 
 
 		 669 aa  110  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  46.51 
 
 		 727 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  53.4 
 
 		 925 aa  110  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  51.49 
 
 		 436 aa  109  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  48.53 
 
 		 479 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  49.52 
 
 		 846 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  47.57 
 
 		 880 aa  108  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  52.88 
 
 		 474 aa  108  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  47.06 
 
 		 494 aa  108  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.92 
 
 		 590 aa  108  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  51.49 
 
 		 393 aa  107  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  45.26 
 
 		 743 aa  105  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  52.58 
 
 		 1007 aa  104  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  47.66 
 
 		 746 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  43.59 
 
 		 744 aa  103  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  49.53 
 
 		 420 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  48.28 
 
 		 469 aa  103  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  48.6 
 
 		 488 aa  103  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  46.08 
 
 		 491 aa  102  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  41.84 
 
 		 589 aa  102  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  50.48 
 
 		 934 aa  101  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  46.08 
 
 		 364 aa  100  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  41.9 
 
 		 913 aa  100  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  44.95 
 
 		 679 aa  99.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  47.11 
 
 		 525 aa  100  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  52 
 
 		 460 aa  99.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  46.3 
 
 		 495 aa  99.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.81 
 
 		 998 aa  99  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  46.6 
 
 		 812 aa  98.6  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  44.12 
 
 		 875 aa  98.6  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  52.13 
 
 		 1209 aa  98.6  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  31.25 
 
 		 1362 aa  98.2  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  40.29 
 
 		 620 aa  98.2  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  44.96 
 
 		 743 aa  97.8  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  44.53 
 
 		 366 aa  97.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  44.76 
 
 		 935 aa  97.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  47.66 
 
 		 763 aa  97.1  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  42.57 
 
 		 906 aa  97.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  43.27 
 
 		 442 aa  96.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  47.12 
 
 		 562 aa  95.9  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  47.17 
 
 		 403 aa  95.1  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  45.1 
 
 		 376 aa  94  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  40.95 
 
 		 990 aa  94  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  45.19 
 
 		 774 aa  93.6  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  34.78 
 
 		 455 aa  93.2  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  48.15 
 
 		 371 aa  93.2  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  44.72 
 
 		 1042 aa  93.2  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  40.2 
 
 		 543 aa  93.6  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  46.08 
 
 		 487 aa  93.6  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  41.75 
 
 		 489 aa  92.4  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  43.14 
 
 		 580 aa  92  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  40.78 
 
 		 681 aa  92.4  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  46.3 
 
 		 499 aa  91.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  44.83 
 
 		 1152 aa  91.7  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  46.3 
 
 		 456 aa  90.9  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3536  cellulose-binding family II  49.04 
 
 		 389 aa  90.5  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0870492  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  40.19 
 
 		 864 aa  90.9  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  38.83 
 
 		 423 aa  90.9  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.62 
 
 		 633 aa  90.1  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  41.18 
 
 		 429 aa  90.1  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>