242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1182 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  749    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  36.66 
 
 		 1042 aa  195  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1183  YceI family protein  44.64 
 
 		 195 aa  136  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  0.710564 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1959  hypothetical protein  39.05 
 
 		 191 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1295  YceI  39.41 
 
 		 196 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.018481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4910  hypothetical protein  39.64 
 
 		 190 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.372677  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2223  YceI family protein  39.18 
 
 		 195 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.128547  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2605  YceI family protein  36.14 
 
 		 191 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.911496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0994  YceI family protein  39.41 
 
 		 193 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000032385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56420  hypothetical protein  39.64 
 
 		 190 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1704  YceI family protein  37.74 
 
 		 192 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4460  YceI family protein  38.24 
 
 		 193 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111755 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2061  YceI family protein  33.73 
 
 		 191 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0930  YceI family protein  37.65 
 
 		 193 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0891  YceI family protein  37.65 
 
 		 193 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1651  YceI family protein  37.74 
 
 		 191 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2893  hypothetical protein  38.36 
 
 		 191 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2513  YceI family protein  37.11 
 
 		 191 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1765  YceI family protein  37.11 
 
 		 191 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1561  YceI family protein  36.48 
 
 		 191 aa  106  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1636  YceI family protein  36.48 
 
 		 191 aa  106  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.431474  normal  0.0372178 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03973  YceI family protein  34.91 
 
 		 194 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000954749  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56510  hypothetical protein  34.88 
 
 		 196 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.844348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1628  YceI family protein  35.85 
 
 		 191 aa  103  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.390594  normal  0.0802652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4915  hypothetical protein  34.88 
 
 		 195 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1131  YceI family protein  37.65 
 
 		 208 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0136  YceI  38.36 
 
 		 198 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1772  YceI family protein  35.22 
 
 		 191 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1809  YceI family protein  35.22 
 
 		 191 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.712609  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2275  YceI  33.99 
 
 		 213 aa  99.4  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000110231  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2476  YceI family protein  33.13 
 
 		 191 aa  99  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00617169  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  51 
 
 		 596 aa  96.3  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4045  YceI  32.35 
 
 		 193 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.033044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1355  YceI  39.64 
 
 		 193 aa  95.1  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  42.57 
 
 		 846 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  43.27 
 
 		 812 aa  93.2  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  48.15 
 
 		 984 aa  92.8  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4350  YceI-like family protein  30.41 
 
 		 193 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  42.16 
 
 		 609 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  39.02 
 
 		 854 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  48.51 
 
 		 588 aa  90.1  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  35.38 
 
 		 1128 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  42.73 
 
 		 633 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  45 
 
 		 590 aa  86.7  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  43.12 
 
 		 925 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  42.74 
 
 		 699 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  42 
 
 		 842 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  40.54 
 
 		 743 aa  84  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  42.06 
 
 		 746 aa  84  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  41.18 
 
 		 628 aa  83.2  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  42.53 
 
 		 495 aa  82.8  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  35.25 
 
 		 491 aa  81.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  37.4 
 
 		 488 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  34.06 
 
 		 479 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  41.18 
 
 		 894 aa  79.7  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  37.62 
 
 		 1055 aa  79.3  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  36.17 
 
 		 669 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  46.91 
 
 		 1209 aa  78.6  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  46.91 
 
 		 1137 aa  78.2  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  40.19 
 
 		 966 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  40.74 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  35.54 
 
 		 744 aa  77.4  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  41.25 
 
 		 743 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3983  YceI family protein  27.38 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  45.68 
 
 		 1298 aa  76.3  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05610  hypothetical protein  35.29 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  38.1 
 
 		 446 aa  75.9  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  42.22 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  33.85 
 
 		 773 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  40.54 
 
 		 499 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  40.38 
 
 		 623 aa  75.9  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  40.2 
 
 		 778 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  40.19 
 
 		 491 aa  74.7  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  45.68 
 
 		 763 aa  74.3  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 		 963 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  37.25 
 
 		 906 aa  73.9  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  34.62 
 
 		 974 aa  73.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  39.6 
 
 		 774 aa  73.9  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  33.33 
 
 		 533 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  35.58 
 
 		 913 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  40.38 
 
 		 842 aa  73.2  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  35.78 
 
 		 525 aa  72.8  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  36.44 
 
 		 880 aa  72.8  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  38.46 
 
 		 794 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  37.17 
 
 		 785 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.38 
 
 		 979 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  34.38 
 
 		 486 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  44.74 
 
 		 460 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  40.59 
 
 		 436 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  45 
 
 		 562 aa  70.9  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  37.5 
 
 		 775 aa  70.1  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  43.42 
 
 		 938 aa  69.7  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  39.76 
 
 		 1007 aa  69.7  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  41.25 
 
 		 474 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  41.38 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  34.48 
 
 		 767 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  38.71 
 
 		 456 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  27.49 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  34.65 
 
 		 681 aa  67  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  39.33 
 
 		 422 aa  67  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>