42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1355 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1355  YceI  100 
 
 
193 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2223  YceI family protein  40.43 
 
 
195 aa  142  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.128547  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03973  YceI family protein  38.74 
 
 
194 aa  137  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000954749  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1959  hypothetical protein  40.43 
 
 
191 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2061  YceI family protein  36.17 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2476  YceI family protein  39.36 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00617169  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1809  YceI family protein  35.11 
 
 
191 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.712609  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1772  YceI family protein  35.11 
 
 
191 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2513  YceI family protein  35.11 
 
 
191 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1765  YceI family protein  35.11 
 
 
191 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1651  YceI family protein  35.43 
 
 
191 aa  121  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0136  YceI  36.52 
 
 
198 aa  120  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2893  hypothetical protein  34.57 
 
 
191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1131  YceI family protein  40 
 
 
208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1636  YceI family protein  34.57 
 
 
191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.431474  normal  0.0372178 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1561  YceI family protein  34.57 
 
 
191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3983  YceI family protein  37.17 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1704  YceI family protein  36.47 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1628  YceI family protein  33.51 
 
 
191 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.390594  normal  0.0802652 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1183  YceI family protein  38.1 
 
 
195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  0.710564 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2605  YceI family protein  33.51 
 
 
191 aa  115  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.911496 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4350  YceI-like family protein  34.2 
 
 
193 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56420  hypothetical protein  36.41 
 
 
190 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1295  YceI  36.05 
 
 
196 aa  101  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.018481  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4045  YceI  34.2 
 
 
193 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.033044  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  39.64 
 
 
371 aa  99.8  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4460  YceI family protein  35.26 
 
 
193 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111755 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0994  YceI family protein  35.47 
 
 
193 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000032385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4910  hypothetical protein  34.78 
 
 
190 aa  99  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.372677  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4915  hypothetical protein  30.46 
 
 
195 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0930  YceI family protein  34.68 
 
 
193 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2275  YceI  34.66 
 
 
213 aa  96.3  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000110231  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56510  hypothetical protein  30.06 
 
 
196 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.844348  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0891  YceI family protein  33.72 
 
 
193 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13317  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  33.72 
 
 
1042 aa  92  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05610  hypothetical protein  31.18 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  30.47 
 
 
212 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2851  YceI family protein  30.77 
 
 
203 aa  45.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344848  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  29.71 
 
 
214 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  27.15 
 
 
208 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  27.45 
 
 
198 aa  42.4  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  25.52 
 
 
190 aa  41.2  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>