48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1704 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1704  YceI family protein  100 
 
 		 192 aa  380  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1765  YceI family protein  53.93 
 
 		 191 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1636  YceI family protein  54.97 
 
 		 191 aa  217  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.431474  normal  0.0372178 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1561  YceI family protein  54.97 
 
 		 191 aa  217  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2513  YceI family protein  53.4 
 
 		 191 aa  217  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1628  YceI family protein  54.45 
 
 		 191 aa  216  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.390594  normal  0.0802652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1809  YceI family protein  52.36 
 
 		 191 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.712609  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1772  YceI family protein  52.36 
 
 		 191 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1651  YceI family protein  52.88 
 
 		 191 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2476  YceI family protein  57.8 
 
 		 191 aa  207  8e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00617169  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2893  hypothetical protein  52.36 
 
 		 191 aa  206  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1959  hypothetical protein  54.59 
 
 		 191 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2275  YceI  57.51 
 
 		 213 aa  195  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000110231  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2223  YceI family protein  50.79 
 
 		 195 aa  191  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.128547  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2605  YceI family protein  49.45 
 
 		 191 aa  180  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.911496 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2061  YceI family protein  47.64 
 
 		 191 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03973  YceI family protein  37.95 
 
 		 194 aa  145  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000954749  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1183  YceI family protein  36.6 
 
 		 195 aa  136  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  0.710564 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0136  YceI  40.11 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1295  YceI  35.33 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.018481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1131  YceI family protein  36.9 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56510  hypothetical protein  33.53 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.844348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4915  hypothetical protein  32.78 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1355  YceI  35.08 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  40.36 
 
 		 1042 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4910  hypothetical protein  35.56 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.372677  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0994  YceI family protein  35.33 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000032385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4350  YceI-like family protein  33.13 
 
 		 193 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4460  YceI family protein  35.33 
 
 		 193 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111755 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4045  YceI  32.14 
 
 		 193 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.033044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  37.74 
 
 		 371 aa  114  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56420  hypothetical protein  34.97 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0891  YceI family protein  34.73 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0930  YceI family protein  34.73 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3983  YceI family protein  28.57 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05610  hypothetical protein  32.18 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  35.25 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  30.25 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0400  hypothetical protein  29.03 
 
 		 246 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00289936  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0806  YceI family protein  26.62 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  34.21 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0790  signal peptide protein  27.04 
 
 		 189 aa  45.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  29.41 
 
 		 219 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0736  YceI family protein  26.62 
 
 		 187 aa  44.7  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  27.66 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  30.34 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  21.43 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  31.07 
 
 		 199 aa  41.6  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>