46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2275 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2275  YceI  100 
 
 		 213 aa  424  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000110231  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1704  YceI family protein  58.76 
 
 		 192 aa  208  6e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1651  YceI family protein  54.26 
 
 		 191 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2893  hypothetical protein  55.81 
 
 		 191 aa  187  9e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1772  YceI family protein  50.26 
 
 		 191 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1809  YceI family protein  50.26 
 
 		 191 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.712609  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2513  YceI family protein  50.26 
 
 		 191 aa  185  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1628  YceI family protein  54.29 
 
 		 191 aa  185  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.390594  normal  0.0802652 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1561  YceI family protein  54.29 
 
 		 191 aa  184  9e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1636  YceI family protein  54.29 
 
 		 191 aa  184  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.431474  normal  0.0372178 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1765  YceI family protein  49.74 
 
 		 191 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1959  hypothetical protein  49.49 
 
 		 191 aa  181  7e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2476  YceI family protein  51.43 
 
 		 191 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00617169  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2605  YceI family protein  48.66 
 
 		 191 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.911496 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2061  YceI family protein  46.84 
 
 		 191 aa  169  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2223  YceI family protein  46.52 
 
 		 195 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.128547  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1295  YceI  36.21 
 
 		 196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.018481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4045  YceI  36.32 
 
 		 193 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.033044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0136  YceI  39.25 
 
 		 198 aa  125  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4350  YceI-like family protein  35.71 
 
 		 193 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1131  YceI family protein  36.26 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1183  YceI family protein  37.7 
 
 		 195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  0.710564 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4910  hypothetical protein  36.42 
 
 		 190 aa  118  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.372677  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4915  hypothetical protein  33.68 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0891  YceI family protein  35.06 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0994  YceI family protein  35.63 
 
 		 193 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000032385 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0930  YceI family protein  35.03 
 
 		 193 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4460  YceI family protein  35.59 
 
 		 193 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56420  hypothetical protein  36.42 
 
 		 190 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56510  hypothetical protein  34.29 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.844348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03973  YceI family protein  35.79 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000954749  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  35.71 
 
 		 371 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1355  YceI  35.2 
 
 		 193 aa  105  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  35.71 
 
 		 1042 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3983  YceI family protein  28.86 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05610  hypothetical protein  30.51 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  27.33 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1711  YceI family protein  30.83 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  30.95 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  27.59 
 
 		 197 aa  42.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  27.59 
 
 		 197 aa  42.4  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  30.53 
 
 		 174 aa  42  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  29.55 
 
 		 182 aa  41.6  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  26.02 
 
 		 182 aa  42  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  28.16 
 
 		 191 aa  41.6  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  30.3 
 
 		 214 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>