More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1207 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  100 
 
 		 197 aa  394  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  98.48 
 
 		 197 aa  388  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  82.56 
 
 		 196 aa  315  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  64.29 
 
 		 201 aa  246  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  63.04 
 
 		 201 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  60 
 
 		 198 aa  238  2.9999999999999997e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  59.3 
 
 		 195 aa  226  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  55.93 
 
 		 186 aa  217  7.999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  56.57 
 
 		 214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  57.06 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  55.37 
 
 		 201 aa  201  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  55.49 
 
 		 182 aa  201  7e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  55.68 
 
 		 201 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  53.71 
 
 		 183 aa  195  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  54.29 
 
 		 183 aa  195  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  54.76 
 
 		 182 aa  195  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  54.6 
 
 		 183 aa  195  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  55.49 
 
 		 200 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3701  YceI  51.43 
 
 		 187 aa  191  8e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  53.18 
 
 		 201 aa  181  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  53.49 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  53.49 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  48.84 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  46.29 
 
 		 182 aa  178  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  48.26 
 
 		 182 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  51.16 
 
 		 183 aa  177  9e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  49.14 
 
 		 177 aa  177  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  45.71 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  46.24 
 
 		 188 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  48.65 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  42.05 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  46.41 
 
 		 182 aa  161  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  44.32 
 
 		 182 aa  160  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  50 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  45.71 
 
 		 189 aa  159  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  46.78 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  46.2 
 
 		 177 aa  159  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  42.86 
 
 		 182 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  46.15 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  41.62 
 
 		 204 aa  155  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  47.13 
 
 		 181 aa  155  5.0000000000000005e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  45.36 
 
 		 182 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  43.86 
 
 		 175 aa  152  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  44 
 
 		 174 aa  152  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  44.79 
 
 		 187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  42.05 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  46.15 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  39.55 
 
 		 191 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  44 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  46.51 
 
 		 181 aa  149  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  42.69 
 
 		 179 aa  148  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1711  YceI family protein  44.57 
 
 		 188 aa  148  5e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  45.14 
 
 		 176 aa  147  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  40.1 
 
 		 189 aa  147  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  41.57 
 
 		 212 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  44.07 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  40.35 
 
 		 184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  43.37 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  46.86 
 
 		 182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  46.86 
 
 		 182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  46.86 
 
 		 182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  41.62 
 
 		 189 aa  144  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  42.31 
 
 		 181 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2032  YceI  43.17 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  39.43 
 
 		 177 aa  141  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07170  hypothetical protein  45.05 
 
 		 181 aa  140  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  42.42 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  42.93 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  42.11 
 
 		 183 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  45.14 
 
 		 181 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  41.71 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  43.59 
 
 		 201 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0441  YceI family protein  44.26 
 
 		 183 aa  138  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.886129  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  42.47 
 
 		 182 aa  137  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0518  YceI family protein  43.09 
 
 		 181 aa  137  7e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000120674  hitchhiker  0.000476131 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  41.76 
 
 		 190 aa  138  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  40.64 
 
 		 181 aa  138  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  44.25 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  43.43 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  38.69 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  41.24 
 
 		 180 aa  135  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  39.55 
 
 		 184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  45.86 
 
 		 183 aa  134  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  41.62 
 
 		 175 aa  134  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  40.91 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  40.91 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  41.52 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  40.57 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  36.26 
 
 		 180 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  40.78 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  39.69 
 
 		 190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  36.08 
 
 		 189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  39.3 
 
 		 193 aa  131  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  36.04 
 
 		 190 aa  130  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  39.18 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  38.01 
 
 		 199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  39.34 
 
 		 196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  40.2 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  40.2 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2685  YceI family protein  40.22 
 
 		 174 aa  129  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>