More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2307 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  100 
 
 
204 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  44.25 
 
 
182 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  46.45 
 
 
187 aa  161  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  45.66 
 
 
183 aa  161  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  45.66 
 
 
183 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  45.4 
 
 
182 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  47.34 
 
 
183 aa  157  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  45.09 
 
 
182 aa  155  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  44.71 
 
 
177 aa  155  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  44.19 
 
 
196 aa  154  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  43.93 
 
 
175 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  42.22 
 
 
182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  44.77 
 
 
174 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  43.37 
 
 
214 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  43.27 
 
 
177 aa  152  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  43.86 
 
 
189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  44.51 
 
 
198 aa  151  7e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  46.82 
 
 
182 aa  150  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  46.43 
 
 
175 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  44.31 
 
 
182 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  42.11 
 
 
184 aa  149  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  42.11 
 
 
182 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  45.35 
 
 
188 aa  149  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  44.77 
 
 
195 aa  149  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2685  YceI family protein  45.09 
 
 
174 aa  148  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  45.66 
 
 
182 aa  148  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  47.4 
 
 
200 aa  148  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  38.51 
 
 
177 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  43.6 
 
 
201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  45.09 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  43.86 
 
 
223 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  45.09 
 
 
197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  39.53 
 
 
180 aa  144  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  43.02 
 
 
201 aa  144  9e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  43.86 
 
 
187 aa  143  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  44.71 
 
 
183 aa  144  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  47.02 
 
 
176 aa  142  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  41.28 
 
 
183 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2711  hypothetical protein  45.73 
 
 
171 aa  140  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440921  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2768  hypothetical protein  45.73 
 
 
171 aa  140  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000157098  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2314  hypothetical protein  46.58 
 
 
171 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.613001  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  43.27 
 
 
176 aa  140  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  44.51 
 
 
181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  41.98 
 
 
178 aa  139  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  39.77 
 
 
190 aa  139  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  39.77 
 
 
175 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  43.86 
 
 
182 aa  138  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  43.86 
 
 
182 aa  138  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  43.86 
 
 
182 aa  138  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  39.88 
 
 
190 aa  138  7e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  42.35 
 
 
184 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  45.56 
 
 
186 aa  137  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  40.36 
 
 
195 aa  136  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1536  hypothetical protein  39.88 
 
 
190 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  38.69 
 
 
190 aa  136  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2032  YceI  41.28 
 
 
192 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267829  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  44.89 
 
 
201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  40.11 
 
 
187 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  39.77 
 
 
187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  39.33 
 
 
179 aa  135  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  44.83 
 
 
201 aa  134  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  42.11 
 
 
178 aa  134  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  39.18 
 
 
177 aa  134  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  43.27 
 
 
183 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  45.51 
 
 
181 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0441  YceI family protein  43.86 
 
 
183 aa  132  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.886129  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  39.18 
 
 
175 aa  132  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1711  YceI family protein  39.64 
 
 
188 aa  132  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  44.85 
 
 
190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  37.06 
 
 
182 aa  132  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  40.76 
 
 
196 aa  132  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  37.57 
 
 
219 aa  132  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1960  hypothetical protein  39.23 
 
 
196 aa  131  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  44.44 
 
 
181 aa  131  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  40.94 
 
 
181 aa  130  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  42.77 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  42.77 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  38.82 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  40 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  40.82 
 
 
195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  43.45 
 
 
189 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  44.85 
 
 
183 aa  128  6e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  41.52 
 
 
181 aa  128  7.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  37.65 
 
 
201 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  38.6 
 
 
199 aa  127  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  44.91 
 
 
180 aa  127  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7583  YceI-like family protein  39.88 
 
 
202 aa  127  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.94246  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  42.05 
 
 
181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  36.18 
 
 
193 aa  123  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  37.91 
 
 
186 aa  122  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  40.7 
 
 
181 aa  121  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  39.88 
 
 
212 aa  121  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07170  hypothetical protein  40.59 
 
 
181 aa  121  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  40.78 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0727  conserved hypothetical protein, YceI family  39.87 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0212414  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  42.33 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  41.76 
 
 
209 aa  119  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  37.77 
 
 
194 aa  118  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  34.01 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0564  hypothetical protein  36.42 
 
 
174 aa  117  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.512882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>