More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7583 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7583  YceI-like family protein  100 
 
 
202 aa  394  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.94246  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  42.86 
 
 
183 aa  145  5e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  40.94 
 
 
183 aa  142  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  42.78 
 
 
186 aa  141  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  39.77 
 
 
182 aa  138  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  42.62 
 
 
201 aa  138  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  44.24 
 
 
183 aa  137  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  43.35 
 
 
219 aa  136  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  44.38 
 
 
178 aa  136  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  41.28 
 
 
182 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  38.69 
 
 
195 aa  134  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  39.26 
 
 
178 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  41.21 
 
 
190 aa  133  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  40.74 
 
 
177 aa  132  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  41.62 
 
 
187 aa  132  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  42.05 
 
 
201 aa  132  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  41.86 
 
 
187 aa  131  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  40.8 
 
 
187 aa  131  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  39.2 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  41.28 
 
 
188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  41.52 
 
 
181 aa  129  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  41.52 
 
 
212 aa  128  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  41.1 
 
 
195 aa  128  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  39.88 
 
 
204 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  40.12 
 
 
182 aa  127  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  38.64 
 
 
183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  38.55 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  41.28 
 
 
181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  37.95 
 
 
181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  42.86 
 
 
176 aa  126  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  37.13 
 
 
182 aa  125  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  38.18 
 
 
181 aa  124  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  36.87 
 
 
182 aa  124  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  36.36 
 
 
196 aa  124  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  38.76 
 
 
182 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2435  YceI family protein  40.12 
 
 
188 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.832405  normal  0.0582212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  37.36 
 
 
182 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  37.36 
 
 
182 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  37.36 
 
 
182 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  37.71 
 
 
197 aa  123  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  40.44 
 
 
181 aa  123  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  37.71 
 
 
197 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  38.82 
 
 
183 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  33.14 
 
 
175 aa  122  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  38.73 
 
 
184 aa  122  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  34.94 
 
 
176 aa  122  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  41.01 
 
 
191 aa  121  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0441  YceI family protein  38.15 
 
 
183 aa  121  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.886129  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  35.84 
 
 
181 aa  121  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0518  YceI family protein  35.68 
 
 
181 aa  121  7e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000120674  hitchhiker  0.000476131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  42.94 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  35.19 
 
 
177 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  38.3 
 
 
182 aa  119  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  37.79 
 
 
189 aa  119  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  36.61 
 
 
209 aa  119  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  34.88 
 
 
179 aa  118  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1960  hypothetical protein  37.1 
 
 
196 aa  117  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  36.36 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  39.53 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1711  YceI family protein  33.93 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  39.29 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  35.58 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  34.73 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07170  hypothetical protein  36.84 
 
 
181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  36.84 
 
 
180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  35.42 
 
 
186 aa  115  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  34.71 
 
 
174 aa  115  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  37.99 
 
 
200 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  38.01 
 
 
182 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  33.13 
 
 
175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  36.46 
 
 
187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  38.29 
 
 
214 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  37.14 
 
 
285 aa  112  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2032  YceI  31.21 
 
 
192 aa  112  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267829  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  36.26 
 
 
184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  34.12 
 
 
185 aa  112  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  31.95 
 
 
177 aa  111  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  34.3 
 
 
181 aa  111  6e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  35.71 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  32.1 
 
 
175 aa  108  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  33.33 
 
 
187 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  39.56 
 
 
201 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  33.87 
 
 
213 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  33.87 
 
 
213 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  33.33 
 
 
183 aa  107  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  35.03 
 
 
201 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  36.05 
 
 
199 aa  106  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  35.03 
 
 
201 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  36 
 
 
223 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  38.12 
 
 
201 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  30.86 
 
 
177 aa  105  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  38.12 
 
 
201 aa  104  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4157  YceI family protein  37.08 
 
 
202 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135809  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  35.62 
 
 
189 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0268  hypothetical protein  36.61 
 
 
232 aa  101  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2885  YceI family protein  33.65 
 
 
229 aa  100  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265419  normal  0.0897618 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  36.24 
 
 
196 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3701  YceI  32.95 
 
 
187 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3033  YceI family protein  36.22 
 
 
224 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  36.84 
 
 
205 aa  99  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>