More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0955 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  100 
 
 		 186 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  43.08 
 
 		 196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  51.55 
 
 		 195 aa  160  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  43.85 
 
 		 214 aa  157  9e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  43.08 
 
 		 197 aa  154  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  43.5 
 
 		 201 aa  152  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  42.05 
 
 		 197 aa  151  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  40.56 
 
 		 201 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  41.97 
 
 		 198 aa  148  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  45.4 
 
 		 201 aa  148  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  44.32 
 
 		 201 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  44.25 
 
 		 201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  44.71 
 
 		 200 aa  140  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  39.44 
 
 		 182 aa  134  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  44.3 
 
 		 201 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  44.3 
 
 		 223 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  44.3 
 
 		 201 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  42.77 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  41.18 
 
 		 182 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  43.12 
 
 		 178 aa  123  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  36.31 
 
 		 186 aa  120  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  37.36 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  42.33 
 
 		 204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  39.64 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  38.46 
 
 		 183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  44.51 
 
 		 188 aa  118  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  35.2 
 
 		 182 aa  117  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  37.5 
 
 		 201 aa  117  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  34.72 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  39.05 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  37.65 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  41.1 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  36.14 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3701  YceI  40.12 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  38.82 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  39.39 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  36.22 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  38.71 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  36.47 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  36.02 
 
 		 177 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  36.05 
 
 		 175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  42.68 
 
 		 187 aa  111  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  34.05 
 
 		 189 aa  111  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  40.12 
 
 		 180 aa  111  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  39.89 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  37.27 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  37.36 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  32.09 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  33.33 
 
 		 195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  37.27 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  34.32 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  35.19 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  37.43 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  35.19 
 
 		 237 aa  106  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  37.2 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1960  hypothetical protein  37.28 
 
 		 196 aa  105  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  35.33 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  36.2 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  36.42 
 
 		 191 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  38.92 
 
 		 186 aa  104  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  36.42 
 
 		 191 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  38.75 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  36.42 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  36.14 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  36.42 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  32.57 
 
 		 206 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  33.53 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  33.88 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  35.11 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  35.26 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  33.88 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  39.19 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  41.5 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  40 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  39.2 
 
 		 194 aa  101  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  42.24 
 
 		 199 aa  101  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  33.93 
 
 		 196 aa  101  6e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  37.89 
 
 		 182 aa  100  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1711  YceI family protein  33.92 
 
 		 188 aa  100  9e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  34.91 
 
 		 207 aa  100  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  36.47 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  37.04 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  36.47 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  36.47 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  34.88 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  36.57 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  36.57 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  31.4 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  34.68 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  37.58 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  36.42 
 
 		 191 aa  99.4  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  33.53 
 
 		 201 aa  99  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  37.78 
 
 		 192 aa  99  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  33.51 
 
 		 200 aa  99  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  35.15 
 
 		 181 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  35.44 
 
 		 175 aa  98.6  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  31.79 
 
 		 177 aa  98.6  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  34.1 
 
 		 191 aa  99  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  35.04 
 
 		 192 aa  98.6  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  38.78 
 
 		 191 aa  99  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>