More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0780 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  403  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  64.67 
 
 		 188 aa  230  8.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3598  hypothetical protein  60.67 
 
 		 199 aa  224  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  61.68 
 
 		 189 aa  221  8e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  57.49 
 
 		 191 aa  215  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  55.03 
 
 		 192 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  55.17 
 
 		 177 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  54.12 
 
 		 191 aa  209  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  55.38 
 
 		 191 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  55.38 
 
 		 191 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  53.85 
 
 		 191 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  55.38 
 
 		 191 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  53.85 
 
 		 191 aa  208  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  55.38 
 
 		 191 aa  208  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  52.2 
 
 		 190 aa  207  5e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  57.49 
 
 		 191 aa  207  6e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  53.85 
 
 		 191 aa  207  7e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  54.84 
 
 		 191 aa  206  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  58.68 
 
 		 191 aa  206  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  53.3 
 
 		 191 aa  206  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  53.51 
 
 		 192 aa  205  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  56.29 
 
 		 189 aa  206  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  58.68 
 
 		 191 aa  205  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  52.2 
 
 		 191 aa  204  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  52.2 
 
 		 191 aa  204  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  52.2 
 
 		 191 aa  204  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  54.35 
 
 		 191 aa  204  8e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  54.35 
 
 		 191 aa  204  8e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  54.35 
 
 		 191 aa  203  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  54.35 
 
 		 191 aa  203  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  54.35 
 
 		 191 aa  203  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  54.35 
 
 		 191 aa  203  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  54.35 
 
 		 191 aa  203  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  54.35 
 
 		 191 aa  203  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  54.35 
 
 		 191 aa  203  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  51.65 
 
 		 191 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  51.08 
 
 		 192 aa  200  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  56.55 
 
 		 192 aa  200  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  54.45 
 
 		 192 aa  200  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  53.89 
 
 		 191 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  55.95 
 
 		 192 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  53.26 
 
 		 192 aa  197  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  53.26 
 
 		 192 aa  197  7e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  53.26 
 
 		 192 aa  197  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  51.37 
 
 		 193 aa  196  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  55.69 
 
 		 192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  51.34 
 
 		 189 aa  194  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  51.87 
 
 		 189 aa  193  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1739  hypothetical protein  50.84 
 
 		 203 aa  189  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000033243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  55.09 
 
 		 176 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3370  hypothetical protein  52.2 
 
 		 191 aa  187  8e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  52.94 
 
 		 198 aa  187  9e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  50.79 
 
 		 208 aa  186  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  52.69 
 
 		 192 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  52.69 
 
 		 192 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  45.05 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  50.3 
 
 		 192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  50.3 
 
 		 192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  50.3 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  49.7 
 
 		 192 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  45.9 
 
 		 179 aa  158  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  40.53 
 
 		 201 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  40.46 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  40.46 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  37.89 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  40.61 
 
 		 183 aa  131  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  41.21 
 
 		 183 aa  131  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  45.39 
 
 		 196 aa  130  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  39.88 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  38.04 
 
 		 182 aa  127  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  40.65 
 
 		 183 aa  127  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  34.1 
 
 		 182 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  38.79 
 
 		 188 aa  124  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  38.18 
 
 		 182 aa  124  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  37.58 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  40.36 
 
 		 195 aa  122  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  41.25 
 
 		 197 aa  121  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  43.97 
 
 		 197 aa  121  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  38.27 
 
 		 186 aa  120  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  40.91 
 
 		 285 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  40.24 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  39.66 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  35.42 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  38.73 
 
 		 196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  39.26 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  44.37 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  38.65 
 
 		 223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  34.66 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  40 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  38.57 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  38.65 
 
 		 201 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  37.86 
 
 		 182 aa  115  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  35.26 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  40 
 
 		 189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1831  YceI  36.69 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.033679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3229  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.474421  normal  0.780413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  39.13 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  37.84 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  40.71 
 
 		 183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  35.03 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>