More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3681 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3681  YceI  100 
 
 		 201 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  48.96 
 
 		 197 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  48.44 
 
 		 197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  49.12 
 
 		 196 aa  165  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  47.7 
 
 		 237 aa  165  4e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  47.13 
 
 		 237 aa  164  9e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  49.7 
 
 		 205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  51.5 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  52.15 
 
 		 235 aa  162  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  48.55 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  51.2 
 
 		 254 aa  159  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  49.71 
 
 		 199 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  50.3 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  43.64 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  46.74 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  50.62 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  43.98 
 
 		 190 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  44.15 
 
 		 193 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  46.11 
 
 		 205 aa  148  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  46.67 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  45.12 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  43.21 
 
 		 209 aa  145  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  44.51 
 
 		 213 aa  143  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  41.36 
 
 		 212 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  39.64 
 
 		 191 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  44.24 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  46.94 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  49.02 
 
 		 204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  49.67 
 
 		 192 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  42.5 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  38.58 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  41.21 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  38.58 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  42.53 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  49.02 
 
 		 192 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  49.02 
 
 		 192 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  40.53 
 
 		 196 aa  134  7.000000000000001e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  43.11 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  42.51 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  45.35 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  45.35 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  45.2 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  43.92 
 
 		 192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  45.35 
 
 		 201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  36.69 
 
 		 216 aa  131  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  43.53 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  37.11 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  43.35 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  43.53 
 
 		 192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  44.63 
 
 		 197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  47.06 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  42.37 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  43.35 
 
 		 179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  40.24 
 
 		 182 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  43.93 
 
 		 191 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  43.6 
 
 		 201 aa  127  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  40.41 
 
 		 189 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  38.17 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  43.26 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  43.26 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  43.26 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  43.26 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  40.96 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  46.79 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  41.95 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  44.85 
 
 		 192 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  47.33 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  42.86 
 
 		 191 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  40.46 
 
 		 190 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  42.86 
 
 		 191 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  35.76 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  42.6 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  42.47 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  46.67 
 
 		 192 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  46.67 
 
 		 192 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  46.67 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  46.67 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  41.11 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  41.11 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  46.67 
 
 		 192 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  46.67 
 
 		 192 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  43.79 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  42.7 
 
 		 191 aa  125  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  42.7 
 
 		 191 aa  125  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  42.7 
 
 		 191 aa  125  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  42.7 
 
 		 191 aa  125  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  42.44 
 
 		 200 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  42.7 
 
 		 191 aa  125  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  42.7 
 
 		 191 aa  125  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  47.37 
 
 		 211 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  42.7 
 
 		 191 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  45.4 
 
 		 201 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  42.51 
 
 		 196 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  41.8 
 
 		 191 aa  124  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  38.37 
 
 		 177 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  41.67 
 
 		 182 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  41.21 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  41.38 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  40.32 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  45.39 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>