More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2531 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  100 
 
 		 186 aa  382  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  36.26 
 
 		 180 aa  119  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  37.58 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1196  YceI family protein  30.9 
 
 		 183 aa  92.8  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00341988  normal  0.225217 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  32.9 
 
 		 186 aa  90.9  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  29.89 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  29.89 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  27.81 
 
 		 196 aa  87  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  32.82 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  33.12 
 
 		 180 aa  85.5  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  40 
 
 		 178 aa  85.5  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  28.79 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  30.07 
 
 		 188 aa  84.7  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  30.53 
 
 		 193 aa  84.7  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  27.06 
 
 		 190 aa  84.3  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  31.89 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  32.35 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4649  YceI family protein  30.46 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.270217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  29.01 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  30 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  32.62 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  32.33 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  33.12 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2851  YceI family protein  27.95 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  29.65 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  30.86 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  34.67 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  32.33 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  25.83 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  32.68 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  34.21 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  33.96 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  30.52 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  36.36 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  27.13 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  34.36 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  35.61 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  29.3 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  33.72 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  31.21 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  32.47 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  29.77 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  31.49 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  30 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  33.99 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  31.21 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  33.33 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  29.77 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  30.13 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  34.85 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  29.77 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  29.09 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  29.77 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  32.12 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  29.65 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  27.91 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  29.77 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  27.43 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  32.93 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  30.57 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  29.27 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  29.09 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  29.09 
 
 		 183 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  25.41 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  28.47 
 
 		 441 aa  72.4  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  32.41 
 
 		 195 aa  72  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4402  YceI family protein  30.32 
 
 		 190 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  31.45 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  30.06 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  32.54 
 
 		 421 aa  71.6  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  28.24 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  29.56 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  27.94 
 
 		 420 aa  71.2  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  31.06 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  31.45 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  30.13 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  33.33 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  30.67 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  33.58 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  30.92 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  29.28 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  32.12 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  28.66 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2185  hypothetical protein  31.45 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  28.99 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  28.66 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1711  YceI family protein  28.83 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  30.52 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  28.72 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  28.72 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  28.22 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  30.67 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  26.8 
 
 		 192 aa  67  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  27.45 
 
 		 192 aa  67  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  32.93 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  28.48 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  29.77 
 
 		 192 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  32.35 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  28.19 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  28.19 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>