More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1680 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  100 
 
 
200 aa  411  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2451  YceI family protein  48.76 
 
 
205 aa  202  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0765  YceI family protein  47.51 
 
 
204 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  37.79 
 
 
196 aa  123  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  39.34 
 
 
201 aa  119  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  35.42 
 
 
196 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  35.47 
 
 
207 aa  117  9e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  34.88 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  39.02 
 
 
179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  38.41 
 
 
195 aa  111  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  36.05 
 
 
182 aa  111  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  37.36 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  31.1 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  35.09 
 
 
216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1739  hypothetical protein  33.69 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000033243  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  37.5 
 
 
192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  37.5 
 
 
192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  32.61 
 
 
182 aa  108  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  34.97 
 
 
212 aa  108  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  31.93 
 
 
210 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  36.18 
 
 
204 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  36.18 
 
 
192 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  36.63 
 
 
199 aa  106  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  36.84 
 
 
192 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  32.02 
 
 
213 aa  105  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  32.02 
 
 
213 aa  105  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  37.16 
 
 
208 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  36.18 
 
 
192 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  36.21 
 
 
188 aa  105  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  36.36 
 
 
198 aa  105  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  37.36 
 
 
177 aa  104  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3229  hypothetical protein  35.36 
 
 
197 aa  103  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.474421  normal  0.780413 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  34.64 
 
 
205 aa  104  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  34.04 
 
 
191 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  34.04 
 
 
191 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  34.04 
 
 
191 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  34.04 
 
 
191 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  34.04 
 
 
191 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  34.04 
 
 
191 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  34.04 
 
 
191 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  33.87 
 
 
191 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  33.87 
 
 
191 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  33.87 
 
 
191 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  33.87 
 
 
191 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  33.51 
 
 
192 aa  102  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  33.51 
 
 
191 aa  101  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  33.51 
 
 
191 aa  101  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  35.93 
 
 
178 aa  101  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  34.32 
 
 
192 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  33.33 
 
 
191 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  33.73 
 
 
192 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  35.63 
 
 
196 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  32.09 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  33.54 
 
 
213 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  34.64 
 
 
191 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  36.26 
 
 
200 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  32.98 
 
 
192 aa  99  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  32.98 
 
 
192 aa  99  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  32.98 
 
 
192 aa  99  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  33.51 
 
 
186 aa  99  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  33.33 
 
 
190 aa  99  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  32.58 
 
 
213 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  32.95 
 
 
237 aa  98.2  7e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  32.95 
 
 
237 aa  98.2  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  34.08 
 
 
191 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  34.1 
 
 
195 aa  97.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  35.84 
 
 
196 aa  96.7  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  32.52 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  30.73 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  32.95 
 
 
182 aa  96.3  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  31.72 
 
 
192 aa  96.3  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  37.72 
 
 
176 aa  95.9  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  32.02 
 
 
175 aa  95.1  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  36.16 
 
 
183 aa  94.4  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  36.72 
 
 
183 aa  94.4  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  31.98 
 
 
202 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  30.57 
 
 
191 aa  94  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  31.55 
 
 
182 aa  94.4  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  31.05 
 
 
191 aa  94  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  31.79 
 
 
189 aa  94  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  30.96 
 
 
191 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  33.14 
 
 
187 aa  93.2  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  36.67 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  31.91 
 
 
192 aa  93.2  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  30.96 
 
 
191 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  32.02 
 
 
191 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  30.96 
 
 
191 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  29.65 
 
 
189 aa  93.2  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  33.33 
 
 
175 aa  93.2  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  33.74 
 
 
206 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  31.84 
 
 
211 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  33.33 
 
 
214 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  30.96 
 
 
191 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  32.57 
 
 
192 aa  92.4  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  34.3 
 
 
184 aa  92.4  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  30.29 
 
 
193 aa  92.4  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  32.28 
 
 
191 aa  92.4  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  36.11 
 
 
197 aa  92.4  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  32.02 
 
 
191 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  31.31 
 
 
193 aa  92.4  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>