More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3499 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  100 
 
 
179 aa  364  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  51.18 
 
 
191 aa  164  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  50.59 
 
 
191 aa  163  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  49.71 
 
 
188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3598  hypothetical protein  48.59 
 
 
199 aa  159  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  47.25 
 
 
191 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  45.6 
 
 
192 aa  158  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  47.25 
 
 
191 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  47.25 
 
 
191 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  45.9 
 
 
196 aa  158  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  47.25 
 
 
191 aa  157  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  46.15 
 
 
191 aa  157  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  43.48 
 
 
201 aa  157  9e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247492 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  46.45 
 
 
191 aa  156  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  46.45 
 
 
191 aa  156  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  46.7 
 
 
191 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  46.45 
 
 
191 aa  156  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  46.45 
 
 
191 aa  156  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  46.45 
 
 
191 aa  156  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  46.45 
 
 
191 aa  156  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  46.45 
 
 
191 aa  156  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  46.45 
 
 
191 aa  156  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  46.45 
 
 
191 aa  156  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  44.81 
 
 
192 aa  155  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  44.26 
 
 
192 aa  155  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  47.31 
 
 
191 aa  155  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  45.11 
 
 
193 aa  154  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  43.41 
 
 
192 aa  153  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  43.41 
 
 
192 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  43.41 
 
 
192 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  46.2 
 
 
213 aa  152  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  46.2 
 
 
213 aa  152  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  44.81 
 
 
191 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  44.51 
 
 
191 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  44.51 
 
 
191 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  43.96 
 
 
192 aa  151  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  44.51 
 
 
191 aa  151  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  43.46 
 
 
191 aa  149  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  47.4 
 
 
191 aa  149  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  42.86 
 
 
191 aa  148  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  42.41 
 
 
191 aa  148  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  43.17 
 
 
192 aa  147  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  42.41 
 
 
191 aa  147  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  43.17 
 
 
192 aa  147  9e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  48.24 
 
 
177 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  45.29 
 
 
189 aa  144  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  40.64 
 
 
191 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  45.35 
 
 
192 aa  143  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  42.08 
 
 
189 aa  143  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  41.15 
 
 
190 aa  142  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1739  hypothetical protein  44.21 
 
 
203 aa  140  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000033243  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3370  hypothetical protein  43.41 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  45.24 
 
 
182 aa  139  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  40.43 
 
 
189 aa  137  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  42.35 
 
 
225 aa  136  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  45.09 
 
 
196 aa  136  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3229  hypothetical protein  42.17 
 
 
197 aa  136  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.474421  normal  0.780413 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  42.69 
 
 
176 aa  136  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  45.66 
 
 
204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  45.66 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  44.51 
 
 
192 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  44.51 
 
 
192 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  44.44 
 
 
198 aa  134  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  40.21 
 
 
189 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  41.36 
 
 
208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  47.55 
 
 
183 aa  132  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  48.25 
 
 
183 aa  129  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  43.35 
 
 
201 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  43.86 
 
 
182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  44.06 
 
 
285 aa  125  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  40.46 
 
 
188 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  39.88 
 
 
187 aa  122  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  41.86 
 
 
192 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  41.86 
 
 
192 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  39.18 
 
 
182 aa  122  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  39.49 
 
 
182 aa  121  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  46.31 
 
 
181 aa  120  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  41.73 
 
 
176 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  40.48 
 
 
182 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  39.18 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  42.28 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  42.66 
 
 
181 aa  119  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  41.04 
 
 
174 aa  118  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  41.32 
 
 
185 aa  119  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  43.14 
 
 
181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  40.48 
 
 
182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  44.37 
 
 
187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  42.94 
 
 
180 aa  117  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  39.27 
 
 
214 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  39.41 
 
 
177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  42.36 
 
 
183 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  39.44 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  41.96 
 
 
181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  38.25 
 
 
207 aa  115  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  45.51 
 
 
182 aa  115  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  44.22 
 
 
186 aa  115  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  41.33 
 
 
187 aa  115  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  37.65 
 
 
183 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  38.24 
 
 
183 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  40.22 
 
 
180 aa  114  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>