More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B3019 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  100 
 
 		 216 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  93.52 
 
 		 216 aa  418  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  72.77 
 
 		 211 aa  300  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0009  YceI like family protein  64.62 
 
 		 216 aa  266  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0007  YceI like family protein  65.31 
 
 		 217 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1154  putative lipoprotein  65.31 
 
 		 217 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0008  putative lipoprotein  65.31 
 
 		 217 aa  264  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1434  YceI like family protein  66.49 
 
 		 199 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311091  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0009  putative lipoprotein  66.49 
 
 		 199 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.686573  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0008  YceI like family protein  66.49 
 
 		 199 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1513  YceI-like family protein  65.73 
 
 		 185 aa  241  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137036  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1385  YceI like family protein  45.79 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00309571  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  39.41 
 
 		 205 aa  135  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  36.5 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  35.53 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  41.18 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  32.61 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  34.85 
 
 		 199 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  36.69 
 
 		 201 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4488  YceI family protein  38.42 
 
 		 252 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.644863  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  36.59 
 
 		 237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  36.59 
 
 		 237 aa  128  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  36.14 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1502  YceI like family protein  51.61 
 
 		 328 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263508  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  34.59 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  36.69 
 
 		 212 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1415  hypothetical protein  51.61 
 
 		 328 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264366  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1185  YceI like family protein  51.61 
 
 		 328 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237197  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0016  YceI-like family protein  51.61 
 
 		 328 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648831  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1156  hypothetical protein  51.61 
 
 		 328 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0144  hypothetical protein  51.61 
 
 		 328 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0826223  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0423  YceI like family protein  51.61 
 
 		 289 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.31148  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  37.99 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0834  YceI family protein  35.05 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.929023  hitchhiker  0.00225936 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  35.09 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  37.08 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  36.57 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  36.57 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  32.18 
 
 		 207 aa  114  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  33.92 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  34.76 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0293  hypothetical protein  33 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000191826  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  32.39 
 
 		 209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  39.64 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  38.38 
 
 		 183 aa  113  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  36.21 
 
 		 214 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  38.95 
 
 		 182 aa  111  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  32.39 
 
 		 213 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  39.43 
 
 		 183 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  31.1 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  38.86 
 
 		 183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  32.39 
 
 		 213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  39.66 
 
 		 188 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  29.48 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  40.11 
 
 		 181 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  30.95 
 
 		 207 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  30.23 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  37.14 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  34.86 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3043  YceI family protein  36.81 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  38.51 
 
 		 187 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0604  YceI family protein  35.93 
 
 		 234 aa  106  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  39.18 
 
 		 183 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0687  hypothetical protein  35.33 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  32.12 
 
 		 197 aa  104  9e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  40.46 
 
 		 176 aa  104  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0976  YceI  34.97 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  39.43 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  32.12 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  37.71 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  37.71 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  34.55 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  33.72 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  35.67 
 
 		 201 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  32.16 
 
 		 205 aa  102  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  36.09 
 
 		 182 aa  101  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  36.99 
 
 		 201 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  35.09 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5437  YceI family protein  32.8 
 
 		 193 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  33.14 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  30.86 
 
 		 196 aa  99.8  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2451  YceI family protein  33.33 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  34.54 
 
 		 190 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  36.72 
 
 		 181 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  33.14 
 
 		 182 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  36.97 
 
 		 179 aa  99.4  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  33.72 
 
 		 201 aa  99  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  38.1 
 
 		 192 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  98.6  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  38.1 
 
 		 192 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0765  YceI family protein  36.26 
 
 		 204 aa  98.6  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  34.1 
 
 		 197 aa  98.6  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  33.14 
 
 		 175 aa  98.6  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  32.34 
 
 		 189 aa  98.6  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  30.67 
 
 		 189 aa  98.2  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  34.88 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  33.53 
 
 		 197 aa  96.7  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  31.93 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  31.4 
 
 		 177 aa  96.7  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  31.74 
 
 		 189 aa  96.3  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>