More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4023 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  100 
 
 		 242 aa  480  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  42.35 
 
 		 199 aa  154  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  43.85 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  39.53 
 
 		 206 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0834  YceI family protein  44.38 
 
 		 201 aa  143  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.929023  hitchhiker  0.00225936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  43.92 
 
 		 205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4488  YceI family protein  42.86 
 
 		 252 aa  138  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.644863  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  40.59 
 
 		 207 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  42.29 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  39.06 
 
 		 213 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  34.98 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  36.87 
 
 		 205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  41.71 
 
 		 196 aa  128  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0293  hypothetical protein  40 
 
 		 231 aa  128  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000191826  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  39.89 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0007  YceI like family protein  40.09 
 
 		 217 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1154  putative lipoprotein  40.09 
 
 		 217 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0008  putative lipoprotein  40.09 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  33.05 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  36.7 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  39 
 
 		 213 aa  123  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  39.5 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  40.23 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  38.54 
 
 		 220 aa  122  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  42.69 
 
 		 190 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0009  putative lipoprotein  40.2 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.686573  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1434  YceI like family protein  40.2 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311091  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0008  YceI like family protein  40.2 
 
 		 199 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  38.8 
 
 		 211 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  39.89 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  38.54 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1513  YceI-like family protein  42.54 
 
 		 185 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137036  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  38.54 
 
 		 209 aa  118  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0009  YceI like family protein  38.16 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0976  YceI  41.36 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  40.11 
 
 		 235 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  39.77 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  39.23 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  39.53 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  35.47 
 
 		 214 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  39.11 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  38.67 
 
 		 192 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  38.55 
 
 		 192 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  38.12 
 
 		 204 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  38.55 
 
 		 192 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  39.41 
 
 		 197 aa  108  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  35.63 
 
 		 182 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  38.82 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1960  hypothetical protein  35.96 
 
 		 196 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  38.98 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  36.27 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  39.53 
 
 		 206 aa  106  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  38.46 
 
 		 181 aa  105  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  39.62 
 
 		 191 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  39.62 
 
 		 191 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  33.33 
 
 		 182 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  39.62 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2265  YceI  39.41 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  39.62 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  38.12 
 
 		 201 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  39.61 
 
 		 189 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  34.72 
 
 		 193 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  39.62 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  35.26 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  38.2 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2185  hypothetical protein  36.96 
 
 		 194 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  34.76 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  40.7 
 
 		 193 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  38.29 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  33.7 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  36 
 
 		 201 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  37.5 
 
 		 201 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  38.59 
 
 		 191 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  38.59 
 
 		 191 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  38.59 
 
 		 191 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  38.59 
 
 		 191 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  37.57 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  38.15 
 
 		 201 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  38.59 
 
 		 191 aa  101  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  38.59 
 
 		 191 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  38.55 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  38.55 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  38.04 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  36.26 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  33.33 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  38.04 
 
 		 191 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  38.04 
 
 		 191 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  31.61 
 
 		 190 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  34.24 
 
 		 180 aa  99.4  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  36 
 
 		 201 aa  99.4  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  33.53 
 
 		 183 aa  99  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  31.09 
 
 		 190 aa  99  6e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  34.68 
 
 		 183 aa  99  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1536  hypothetical protein  30.57 
 
 		 190 aa  99  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  35.63 
 
 		 195 aa  99  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  36.96 
 
 		 200 aa  99  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  34.1 
 
 		 183 aa  98.6  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  34.1 
 
 		 182 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  36.31 
 
 		 188 aa  97.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  37.43 
 
 		 191 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>