More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0687 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0687  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  478  1e-134  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0604  YceI family protein  97.86 
 
 		 234 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  62.69 
 
 		 206 aa  266  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3043  YceI family protein  58.29 
 
 		 210 aa  241  6e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  39.26 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  36.17 
 
 		 206 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  36.14 
 
 		 202 aa  111  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  33.93 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  35.93 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  37.64 
 
 		 183 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  33.87 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  33.7 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  35.33 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  38.07 
 
 		 183 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  35.47 
 
 		 201 aa  105  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  33.86 
 
 		 193 aa  105  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  34.81 
 
 		 199 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  34.73 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  35.96 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  35.37 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  33.33 
 
 		 196 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  35.88 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  33.33 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  34.12 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  33.71 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  34.34 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  32.76 
 
 		 182 aa  99.4  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  33.95 
 
 		 205 aa  99  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  32.93 
 
 		 211 aa  99  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  34.38 
 
 		 207 aa  98.6  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  35.88 
 
 		 213 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  34.12 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  35.18 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1513  YceI-like family protein  36.42 
 
 		 185 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137036  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0008  YceI like family protein  36.42 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  32.98 
 
 		 191 aa  97.1  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  35.05 
 
 		 197 aa  96.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0009  putative lipoprotein  36.42 
 
 		 199 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.686573  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1434  YceI like family protein  36.42 
 
 		 199 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311091  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0007  YceI like family protein  36.42 
 
 		 217 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1154  putative lipoprotein  36.42 
 
 		 217 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0008  putative lipoprotein  36.42 
 
 		 217 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0765  YceI family protein  31.72 
 
 		 204 aa  95.9  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0009  YceI like family protein  33.93 
 
 		 216 aa  95.9  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  31.1 
 
 		 237 aa  95.5  7e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  31.1 
 
 		 237 aa  95.1  8e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  31.32 
 
 		 201 aa  95.1  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  32.93 
 
 		 205 aa  94.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  34.13 
 
 		 198 aa  91.7  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  34.32 
 
 		 198 aa  91.7  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0976  YceI  35.75 
 
 		 213 aa  91.7  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  30.89 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  89.7  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2185  hypothetical protein  32.34 
 
 		 194 aa  89.4  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  35.47 
 
 		 242 aa  88.6  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  33.92 
 
 		 198 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1831  YceI  31.36 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.033679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  29.47 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  31.25 
 
 		 193 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  30.54 
 
 		 192 aa  86.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  29.57 
 
 		 190 aa  86.7  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  29.83 
 
 		 179 aa  86.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  29.57 
 
 		 190 aa  86.3  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  30.43 
 
 		 207 aa  85.5  6e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  33.92 
 
 		 198 aa  85.5  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  29.24 
 
 		 213 aa  85.5  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  29.24 
 
 		 213 aa  85.5  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  30.32 
 
 		 195 aa  85.1  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0834  YceI family protein  31.66 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.929023  hitchhiker  0.00225936 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  31.64 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  32.14 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  31.21 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  31.64 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  31.18 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  29.9 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  32.37 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  32.76 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1536  hypothetical protein  29.03 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  32.76 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  27.27 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  31.36 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  29.41 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1960  hypothetical protein  29.63 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5437  YceI family protein  30.59 
 
 		 193 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  29.38 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  28.04 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  30.43 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  28.09 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  25.93 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  30.11 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  32.57 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  29.94 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2329  YceI family protein  30.22 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.664269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  29.59 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  30.77 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  29.35 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  31.77 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  31.77 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  29.65 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  31.4 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>