More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0765 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0765  YceI family protein  100 
 
 		 204 aa  411  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  47.21 
 
 		 200 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2451  YceI family protein  46.8 
 
 		 205 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  41.81 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  43.72 
 
 		 201 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  35.29 
 
 		 207 aa  125  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  35.29 
 
 		 207 aa  125  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  36.7 
 
 		 205 aa  118  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  35.2 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  35.68 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  35.92 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  33.33 
 
 		 206 aa  111  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  36.7 
 
 		 179 aa  111  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  31.47 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  31.47 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  35.59 
 
 		 177 aa  109  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  34.91 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1536  hypothetical protein  31.47 
 
 		 190 aa  109  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  35.18 
 
 		 192 aa  108  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  35.32 
 
 		 199 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  36.68 
 
 		 191 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  36.68 
 
 		 191 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  36.68 
 
 		 191 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  36.18 
 
 		 191 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  36.18 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  36.18 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  36.18 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  36.18 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  36.18 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  36.18 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  36.18 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  36.18 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  38.22 
 
 		 192 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  38.22 
 
 		 192 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  38.64 
 
 		 183 aa  105  6e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  35.59 
 
 		 196 aa  105  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  34.01 
 
 		 189 aa  104  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  35.68 
 
 		 191 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  35.68 
 
 		 191 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  34.67 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  34.03 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  34.81 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  33.89 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  37.22 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  33.89 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  35.96 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  33.91 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  35.29 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  36.78 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  35.05 
 
 		 191 aa  102  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  34.12 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  35.43 
 
 		 192 aa  101  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  34.17 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  35.75 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  34.15 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  43.33 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  34.36 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  33.89 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  33.85 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  35.2 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  35.2 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  35.2 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  39.23 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  34.97 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  35.36 
 
 		 191 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  32.54 
 
 		 178 aa  99  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  34.83 
 
 		 182 aa  98.6  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  38.46 
 
 		 192 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  37.69 
 
 		 192 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  30.1 
 
 		 188 aa  98.2  6e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  37.69 
 
 		 204 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  34.86 
 
 		 183 aa  98.2  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  35.36 
 
 		 191 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  31.64 
 
 		 182 aa  98.2  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3229  hypothetical protein  32.18 
 
 		 197 aa  98.2  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.474421  normal  0.780413 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  36.42 
 
 		 191 aa  98.2  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3598  hypothetical protein  30.85 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  32.16 
 
 		 195 aa  97.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  34.05 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  36.46 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  32.86 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0604  YceI family protein  32.09 
 
 		 234 aa  96.7  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  33.91 
 
 		 188 aa  97.1  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  35.06 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  31.46 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  32.65 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  33.16 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  33 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  32.02 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  33.16 
 
 		 191 aa  95.5  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  31.47 
 
 		 186 aa  95.9  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  36.78 
 
 		 180 aa  95.9  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  30.29 
 
 		 205 aa  95.5  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  32.24 
 
 		 182 aa  95.5  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  31.13 
 
 		 205 aa  95.5  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0687  hypothetical protein  32.43 
 
 		 234 aa  95.1  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  32.12 
 
 		 191 aa  95.1  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  32.64 
 
 		 191 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  33.16 
 
 		 191 aa  95.1  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  32.64 
 
 		 191 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>