More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2208 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  100 
 
 
207 aa  422  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  96.14 
 
 
207 aa  412  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1848  YceI  47.95 
 
 
200 aa  179  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.735332 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1515  YceI family protein  38.12 
 
 
202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.601487  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  43.11 
 
 
196 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  42.51 
 
 
201 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  38.2 
 
 
212 aa  132  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  37.36 
 
 
237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  38.27 
 
 
237 aa  126  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  38.71 
 
 
205 aa  122  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  36.32 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  34.03 
 
 
191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  38.51 
 
 
202 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  36.21 
 
 
199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0765  YceI family protein  35.29 
 
 
204 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  35.47 
 
 
200 aa  117  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  35 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  37.11 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  39.44 
 
 
179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  37.87 
 
 
235 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  35.56 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  33.13 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  35.93 
 
 
190 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  35.98 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  37.5 
 
 
193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  36.65 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  37.58 
 
 
254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  32.99 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  38.1 
 
 
177 aa  112  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  38.2 
 
 
201 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  38.2 
 
 
223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  37.64 
 
 
201 aa  111  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  33.33 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  32.37 
 
 
193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  30.81 
 
 
216 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  37.11 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  28.91 
 
 
216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  37.5 
 
 
201 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3598  hypothetical protein  38.98 
 
 
199 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  36.69 
 
 
189 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  35.23 
 
 
189 aa  107  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  37.5 
 
 
201 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  32.67 
 
 
199 aa  106  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  37.5 
 
 
187 aa  105  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  31.72 
 
 
190 aa  105  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  31.18 
 
 
190 aa  104  7e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  38.79 
 
 
188 aa  104  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2185  hypothetical protein  32.26 
 
 
194 aa  104  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  34.48 
 
 
187 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  34.05 
 
 
189 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1536  hypothetical protein  32.26 
 
 
190 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  33.14 
 
 
182 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  33.99 
 
 
191 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  35.03 
 
 
207 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  36.02 
 
 
196 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  36.65 
 
 
192 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  30.39 
 
 
201 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  33.99 
 
 
191 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  33.99 
 
 
191 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  34.43 
 
 
191 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  37.04 
 
 
201 aa  102  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  34.02 
 
 
192 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  35.08 
 
 
192 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  36.41 
 
 
201 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  31.52 
 
 
190 aa  101  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  32.63 
 
 
199 aa  101  8e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  34.55 
 
 
192 aa  101  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  35.64 
 
 
193 aa  101  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  34.21 
 
 
197 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  35.53 
 
 
184 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  32.76 
 
 
213 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  34.2 
 
 
192 aa  99.8  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  34.2 
 
 
192 aa  99.8  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  34.2 
 
 
192 aa  99.8  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  33.5 
 
 
191 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3229  hypothetical protein  31.66 
 
 
197 aa  99.8  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.474421  normal  0.780413 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  33.16 
 
 
191 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  32.76 
 
 
213 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  33.52 
 
 
181 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  31.28 
 
 
193 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  31.93 
 
 
195 aa  99.8  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  32.42 
 
 
181 aa  99.4  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  34.2 
 
 
191 aa  99  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  34.2 
 
 
191 aa  99  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  34.2 
 
 
191 aa  99  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  33.91 
 
 
188 aa  99.4  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  34.2 
 
 
191 aa  99  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  34.03 
 
 
192 aa  99  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  34.2 
 
 
191 aa  99  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  34.2 
 
 
191 aa  99  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  32.43 
 
 
206 aa  99  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  34.97 
 
 
197 aa  98.2  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  34.2 
 
 
191 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  30.36 
 
 
218 aa  98.2  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  35.75 
 
 
192 aa  98.2  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  34.93 
 
 
199 aa  97.8  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  36.76 
 
 
192 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  35.71 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  33.68 
 
 
191 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  36.96 
 
 
190 aa  97.8  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>