More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5437 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5437  YceI family protein  100 
 
 		 193 aa  387  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  45.2 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  45.98 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  44.69 
 
 		 202 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  42.86 
 
 		 205 aa  145  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  42.86 
 
 		 207 aa  144  8.000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  42.13 
 
 		 213 aa  141  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  42.46 
 
 		 199 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  39.77 
 
 		 210 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  36.21 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  36.93 
 
 		 212 aa  124  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  37.85 
 
 		 205 aa  124  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  35.63 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  35.06 
 
 		 213 aa  118  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  37.89 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  30.81 
 
 		 220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  32.95 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  33.14 
 
 		 237 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0976  YceI  38.55 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2265  YceI  36.41 
 
 		 219 aa  101  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1434  YceI like family protein  34.92 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311091  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0009  putative lipoprotein  34.92 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.686573  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0007  YceI like family protein  34.92 
 
 		 217 aa  101  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1154  putative lipoprotein  34.92 
 
 		 217 aa  101  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1513  YceI-like family protein  35.52 
 
 		 185 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137036  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  32.8 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  32.93 
 
 		 254 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0008  putative lipoprotein  34.39 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0008  YceI like family protein  33.86 
 
 		 199 aa  98.6  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0009  YceI like family protein  34.21 
 
 		 216 aa  98.2  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  28.65 
 
 		 190 aa  97.8  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  32.95 
 
 		 235 aa  97.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  31.74 
 
 		 196 aa  95.5  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  30.32 
 
 		 216 aa  94.4  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  30.39 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  30.12 
 
 		 174 aa  92.8  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  31.43 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  30.46 
 
 		 175 aa  92  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  33.13 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  35.03 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  32.2 
 
 		 213 aa  89  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  32.2 
 
 		 213 aa  89  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  29.79 
 
 		 197 aa  88.6  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  36.59 
 
 		 206 aa  88.2  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  31.52 
 
 		 197 aa  87.8  9e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  31.61 
 
 		 225 aa  87.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  31.82 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  28.07 
 
 		 189 aa  86.3  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  31.52 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  28.14 
 
 		 177 aa  86.3  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  33.96 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  32.96 
 
 		 187 aa  85.5  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  32.95 
 
 		 198 aa  84.7  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  32.97 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  29.82 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0604  YceI family protein  31.76 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  32.47 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  30.29 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  29.59 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  32.16 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  32.18 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0687  hypothetical protein  30.59 
 
 		 234 aa  81.3  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  35.63 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  30.34 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  32.37 
 
 		 183 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  29.65 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  27.68 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  31.07 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  32.75 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0564  hypothetical protein  26.44 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0834  YceI family protein  31.11 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.929023  hitchhiker  0.00225936 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  31.25 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  28.65 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  28.99 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  31.15 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  31.82 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  29.48 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2185  hypothetical protein  33.14 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  29.22 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4488  YceI family protein  29.26 
 
 		 252 aa  78.2  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.644863  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  29.31 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  31.36 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  31.33 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  30.91 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  30 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  27.95 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  29.7 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  29.03 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  28.09 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  29.34 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  27.32 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  27.32 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  27.17 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  31.4 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1536  hypothetical protein  26.44 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  30.54 
 
 		 175 aa  74.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  31.06 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  29.73 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  27.81 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  29.01 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>