More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0293 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0293  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000191826  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  39.38 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0834  YceI family protein  38.71 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.929023  hitchhiker  0.00225936 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  33 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  32.5 
 
 		 216 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4488  YceI family protein  41.41 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.644863  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  29.95 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0007  YceI like family protein  33.67 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1154  putative lipoprotein  33.67 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0009  putative lipoprotein  33.67 
 
 		 199 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.686573  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0008  putative lipoprotein  33.67 
 
 		 217 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  35.91 
 
 		 199 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  31.69 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1434  YceI like family protein  33.67 
 
 		 199 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311091  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0008  YceI like family protein  33.66 
 
 		 199 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1513  YceI-like family protein  33.51 
 
 		 185 aa  98.2  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137036  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0009  YceI like family protein  31.46 
 
 		 216 aa  96.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  34.81 
 
 		 206 aa  92  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  35.59 
 
 		 201 aa  92  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  35.58 
 
 		 196 aa  91.7  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  33.98 
 
 		 202 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  33.7 
 
 		 213 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  31.89 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  31.37 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  34.72 
 
 		 201 aa  88.6  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  31.69 
 
 		 190 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  32.61 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  34.2 
 
 		 201 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  33.15 
 
 		 213 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  33.68 
 
 		 223 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  34.43 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  31.67 
 
 		 193 aa  86.3  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  34.81 
 
 		 183 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  30.96 
 
 		 199 aa  85.5  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  35.35 
 
 		 205 aa  85.5  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  34.78 
 
 		 182 aa  85.5  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  35.79 
 
 		 235 aa  85.5  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  34.29 
 
 		 213 aa  85.1  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0976  YceI  37.28 
 
 		 213 aa  85.1  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  31.67 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  31.67 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  32.11 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  32.91 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  32.31 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  32.43 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  37.65 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  31.38 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  37.79 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  35.44 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7583  YceI-like family protein  32.4 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.94246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  31.72 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  30.39 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  29.89 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  34.97 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  35.71 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  35.71 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  38.24 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  38.24 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  38.24 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  37.06 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  37.06 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  37.06 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  37.06 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  37.06 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  37.06 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  31.22 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  31.22 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  37.06 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  37.06 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  31.58 
 
 		 201 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  31.77 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  33.93 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  32.91 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  36.47 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  28.65 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  30.73 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  28.5 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  31.21 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  33.93 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  33.93 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  30.81 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  32.37 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  30.53 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  31.67 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  30.89 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  31.01 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  32.68 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  29.11 
 
 		 182 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3043  YceI family protein  28.95 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1385  YceI like family protein  26.67 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00309571  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  28.93 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  32.52 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  30.16 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  33.71 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  32.65 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2265  YceI  32.42 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  32.65 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  30 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>