More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0834 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0834  YceI family protein  100 
 
 
201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.929023  hitchhiker  0.00225936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  44.25 
 
 
242 aa  137  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  37.5 
 
 
206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  37.63 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4488  YceI family protein  42.05 
 
 
252 aa  128  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.644863  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  36.92 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  35.83 
 
 
205 aa  125  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1513  YceI-like family protein  43.93 
 
 
185 aa  121  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137036  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0008  YceI like family protein  43.35 
 
 
199 aa  121  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1434  YceI like family protein  43.35 
 
 
199 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311091  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  37.24 
 
 
199 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0009  putative lipoprotein  43.35 
 
 
199 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.686573  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  35.75 
 
 
216 aa  121  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0007  YceI like family protein  43.35 
 
 
217 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1154  putative lipoprotein  43.35 
 
 
217 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0008  putative lipoprotein  43.35 
 
 
217 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0009  YceI like family protein  40.1 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  35.05 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  37.99 
 
 
211 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0293  hypothetical protein  38.71 
 
 
231 aa  118  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000191826  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  37.95 
 
 
213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  36.72 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  33.52 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  34.86 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  34.86 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  34.41 
 
 
205 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  33 
 
 
205 aa  107  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  34.29 
 
 
209 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  34.63 
 
 
204 aa  106  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0976  YceI  37.77 
 
 
213 aa  102  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  36.16 
 
 
187 aa  101  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  38.78 
 
 
196 aa  101  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  35.91 
 
 
181 aa  101  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  38.85 
 
 
212 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  34.44 
 
 
188 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  33.33 
 
 
190 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  32.93 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  34.1 
 
 
182 aa  99  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  31.79 
 
 
201 aa  99  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  34.71 
 
 
182 aa  99  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  33.92 
 
 
200 aa  98.2  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  28.34 
 
 
190 aa  97.1  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  33.89 
 
 
182 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  27.81 
 
 
190 aa  95.9  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  30.89 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  34.62 
 
 
180 aa  95.9  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  36.67 
 
 
192 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  36.3 
 
 
191 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  36.14 
 
 
192 aa  95.5  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  35.2 
 
 
180 aa  95.1  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  35.03 
 
 
191 aa  94.7  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  35.03 
 
 
191 aa  94.7  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  36 
 
 
192 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  35.03 
 
 
191 aa  94.7  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  35.03 
 
 
191 aa  94.7  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  35.03 
 
 
191 aa  94.7  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  35.03 
 
 
191 aa  94.7  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0727  conserved hypothetical protein, YceI family  28.34 
 
 
190 aa  94.7  9e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0212414  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  35.03 
 
 
191 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  35.03 
 
 
191 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1536  hypothetical protein  27.27 
 
 
190 aa  94  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  31.22 
 
 
207 aa  94  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  35.03 
 
 
191 aa  94  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  35.33 
 
 
206 aa  94  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  27.53 
 
 
189 aa  94.4  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  29.32 
 
 
189 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  35.54 
 
 
192 aa  93.6  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  35.33 
 
 
204 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  36.16 
 
 
187 aa  92.8  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  31.98 
 
 
197 aa  92.8  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  33.14 
 
 
175 aa  92.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  35.33 
 
 
192 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  37.33 
 
 
191 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2265  YceI  32.61 
 
 
219 aa  93.2  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  37.33 
 
 
191 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  37.33 
 
 
191 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  37.33 
 
 
191 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  35.84 
 
 
183 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  35.59 
 
 
183 aa  92  5e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0765  YceI family protein  35.36 
 
 
204 aa  92  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  29.41 
 
 
188 aa  92  6e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  35.97 
 
 
192 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  38.74 
 
 
192 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  33.94 
 
 
192 aa  91.3  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  31.41 
 
 
190 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  36.67 
 
 
191 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  35.21 
 
 
184 aa  90.9  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  33.33 
 
 
192 aa  89.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  36.09 
 
 
183 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  34.68 
 
 
183 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  39.64 
 
 
191 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  34.46 
 
 
182 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  34.97 
 
 
177 aa  90.5  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  34.46 
 
 
182 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  33.33 
 
 
192 aa  89.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  34.46 
 
 
182 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  33.33 
 
 
192 aa  89.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  32 
 
 
192 aa  89.4  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  34.03 
 
 
192 aa  89.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  36.24 
 
 
192 aa  89.4  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.599107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>