More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_1154 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0007  YceI like family protein  100 
 
 
217 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1154  putative lipoprotein  100 
 
 
217 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0008  putative lipoprotein  99.54 
 
 
217 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0009  putative lipoprotein  99.5 
 
 
199 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.686573  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0009  YceI like family protein  91.67 
 
 
216 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1434  YceI like family protein  99.5 
 
 
199 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311091  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0008  YceI like family protein  98.49 
 
 
199 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1513  YceI-like family protein  98.38 
 
 
185 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137036  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  67.57 
 
 
211 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  65.31 
 
 
216 aa  265  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  64.4 
 
 
216 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1385  YceI like family protein  46.19 
 
 
243 aa  152  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00309571  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  41.24 
 
 
205 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4488  YceI family protein  41.9 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.644863  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  34.95 
 
 
220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  37.31 
 
 
205 aa  122  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0834  YceI family protein  43.35 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.929023  hitchhiker  0.00225936 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  34.5 
 
 
237 aa  118  7e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  34.5 
 
 
237 aa  118  7e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  36.57 
 
 
199 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  36.78 
 
 
206 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  37.02 
 
 
213 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  35 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  36.75 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  41.48 
 
 
242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1156  hypothetical protein  51.67 
 
 
328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1185  YceI like family protein  51.67 
 
 
328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237197  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  36 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0423  YceI like family protein  51.67 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.31148  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0144  hypothetical protein  51.67 
 
 
328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0826223  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0016  YceI-like family protein  50.83 
 
 
328 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648831  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  37.21 
 
 
196 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  34.52 
 
 
254 aa  106  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1415  hypothetical protein  50 
 
 
328 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264366  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1502  YceI like family protein  50 
 
 
328 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263508  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  34.91 
 
 
213 aa  105  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  34.91 
 
 
213 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  39.89 
 
 
181 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  34.71 
 
 
190 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  36.93 
 
 
206 aa  102  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  34.32 
 
 
209 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  32.02 
 
 
207 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  34.29 
 
 
235 aa  102  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  36.46 
 
 
188 aa  101  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5437  YceI family protein  34.92 
 
 
193 aa  101  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0604  YceI family protein  37.36 
 
 
234 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0976  YceI  38.55 
 
 
213 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0293  hypothetical protein  33.67 
 
 
231 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000191826  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  35.09 
 
 
205 aa  98.6  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  31.93 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3043  YceI family protein  36.36 
 
 
210 aa  97.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  33.53 
 
 
177 aa  96.7  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0687  hypothetical protein  36.42 
 
 
234 aa  96.3  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  36.21 
 
 
182 aa  96.3  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  36.61 
 
 
187 aa  95.1  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  35.58 
 
 
189 aa  92.8  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  36.27 
 
 
214 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2329  YceI family protein  32.58 
 
 
211 aa  92.4  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.664269  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  34.41 
 
 
183 aa  92  5e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  31.25 
 
 
213 aa  92  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  31.25 
 
 
213 aa  92  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  32.54 
 
 
197 aa  91.7  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  30.61 
 
 
197 aa  91.3  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  32.98 
 
 
188 aa  90.9  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  33.93 
 
 
196 aa  90.5  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  32.76 
 
 
196 aa  89.7  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  31.87 
 
 
182 aa  89.7  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  32.6 
 
 
200 aa  89.4  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  34.83 
 
 
178 aa  89  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  34.48 
 
 
212 aa  88.6  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  34.5 
 
 
175 aa  88.2  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  31.74 
 
 
195 aa  87.8  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2451  YceI family protein  33.91 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  36.72 
 
 
181 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0564  hypothetical protein  30.46 
 
 
174 aa  87  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  29.25 
 
 
188 aa  87  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  27.93 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  35.08 
 
 
190 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  32.54 
 
 
192 aa  86.3  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  28 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  33.92 
 
 
180 aa  85.9  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  31.72 
 
 
182 aa  85.5  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  32.04 
 
 
189 aa  85.5  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  35.06 
 
 
183 aa  85.1  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  34.62 
 
 
182 aa  85.1  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  29.59 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  31.84 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  35.63 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  35.06 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0765  YceI family protein  32.58 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  36.31 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  30.11 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  30.48 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  33.15 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  32.09 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  33.52 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  35.47 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  30.54 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  33.16 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  31.21 
 
 
175 aa  82  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>