More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0621 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  100 
 
 		 213 aa  443  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  100 
 
 		 213 aa  443  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  60.54 
 
 		 225 aa  248  4e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  46.2 
 
 		 179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  40.57 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  43.5 
 
 		 196 aa  141  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  41.3 
 
 		 205 aa  137  8.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  42.2 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  42.2 
 
 		 192 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  38.51 
 
 		 188 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  38.58 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  41.38 
 
 		 191 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  46.79 
 
 		 205 aa  135  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  41.38 
 
 		 192 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  40.46 
 
 		 196 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  40.8 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  40.8 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  40.45 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  39.31 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  41.38 
 
 		 192 aa  129  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  39.31 
 
 		 192 aa  128  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  41.38 
 
 		 191 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  41.38 
 
 		 191 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  41.38 
 
 		 191 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  41.38 
 
 		 191 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  39.59 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  40.96 
 
 		 192 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  40.91 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  38.73 
 
 		 191 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  38.73 
 
 		 191 aa  126  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  38.73 
 
 		 191 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  38.73 
 
 		 191 aa  126  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  38.73 
 
 		 191 aa  126  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  38.73 
 
 		 191 aa  126  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  40.91 
 
 		 197 aa  126  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  38.73 
 
 		 191 aa  126  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  38.15 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  38.73 
 
 		 191 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  40.57 
 
 		 191 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  38.73 
 
 		 191 aa  126  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  37.95 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  40.36 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  35.16 
 
 		 198 aa  125  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  34.87 
 
 		 193 aa  124  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  40 
 
 		 237 aa  124  9e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  39.55 
 
 		 195 aa  124  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  38.07 
 
 		 192 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  38.07 
 
 		 192 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  38.07 
 
 		 192 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  37.95 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  38.69 
 
 		 205 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  39.41 
 
 		 237 aa  122  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  37.57 
 
 		 192 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  35.29 
 
 		 216 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  37.36 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  37.64 
 
 		 186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  39.77 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  38.55 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  31.94 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  41.24 
 
 		 182 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  38.42 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  36.84 
 
 		 196 aa  118  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  37.57 
 
 		 235 aa  118  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  37.43 
 
 		 187 aa  118  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  35.29 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  37.5 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  38.71 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  36.57 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  36 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  38.15 
 
 		 254 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  38.98 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  39.89 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  31.16 
 
 		 191 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  35.61 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  38.07 
 
 		 200 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  36.78 
 
 		 177 aa  116  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  36.42 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  31.16 
 
 		 191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  34.1 
 
 		 176 aa  115  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1739  hypothetical protein  34.38 
 
 		 203 aa  115  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000033243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  35.26 
 
 		 191 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  37.36 
 
 		 213 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  31.16 
 
 		 191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  32.84 
 
 		 191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  37.71 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  34.1 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  36.99 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  36.73 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  31.25 
 
 		 189 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  35.59 
 
 		 182 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  35.11 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3598  hypothetical protein  33.91 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  37.36 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  39.77 
 
 		 180 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  37.57 
 
 		 182 aa  111  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  33.66 
 
 		 188 aa  111  7.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  32.97 
 
 		 189 aa  111  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>