More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2796 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2796  YceI  100 
 
 		 189 aa  381  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  74.55 
 
 		 192 aa  262  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  58.15 
 
 		 191 aa  225  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  52.91 
 
 		 196 aa  223  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  41.88 
 
 		 192 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  50.66 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  42.49 
 
 		 193 aa  158  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  50.34 
 
 		 187 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  50.34 
 
 		 187 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  51.01 
 
 		 187 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  50.34 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  50.34 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  42.86 
 
 		 189 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  50.34 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  50.34 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  46.75 
 
 		 192 aa  154  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  47.8 
 
 		 189 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  47.68 
 
 		 193 aa  150  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  47.68 
 
 		 193 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  47.68 
 
 		 193 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  47.68 
 
 		 193 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  48.34 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  48.34 
 
 		 195 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  44.94 
 
 		 201 aa  148  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  45.58 
 
 		 198 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  46.36 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  47.59 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  42.93 
 
 		 189 aa  145  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  44.44 
 
 		 191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  41.67 
 
 		 198 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  43.6 
 
 		 192 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  44.31 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  42.77 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  41.07 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  42.17 
 
 		 196 aa  141  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  43.71 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  40.59 
 
 		 196 aa  140  9e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  42.11 
 
 		 196 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  40.94 
 
 		 237 aa  134  8e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  40.35 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  39.05 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  36.61 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  32.1 
 
 		 218 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  36.61 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  42.26 
 
 		 254 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  36.13 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  39.57 
 
 		 205 aa  123  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  40.72 
 
 		 235 aa  122  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  41.46 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  35.48 
 
 		 188 aa  122  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  40.53 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  35.85 
 
 		 211 aa  120  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  39.08 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  33.13 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0806  YceI family protein  36.96 
 
 		 187 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  37.72 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  37.82 
 
 		 214 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  37.16 
 
 		 199 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  35.64 
 
 		 191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0790  signal peptide protein  36.11 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  37.91 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  43.21 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1032  hypothetical protein  44.92 
 
 		 132 aa  112  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.955101  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0736  YceI family protein  36.41 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  38.46 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0830  YceI  35.12 
 
 		 199 aa  111  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0387934  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  36 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  37.99 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  38.54 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  42.69 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  36.5 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  34.57 
 
 		 188 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  42.69 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  38.54 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  34.74 
 
 		 188 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  42.69 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  35.8 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2185  hypothetical protein  35.91 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  40.12 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  38.02 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  38.02 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  38.02 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  38.02 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  38.02 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  38.02 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  37.5 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  37.5 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  34.04 
 
 		 191 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  37.5 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  34.04 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  35.29 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  38.98 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  37.5 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1782  YceI  33.33 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0100028 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1463  putative signal peptide protein  38.41 
 
 		 151 aa  104  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.036668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  37.69 
 
 		 196 aa  104  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  36.7 
 
 		 189 aa  104  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  36.98 
 
 		 191 aa  104  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  36.98 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>